Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHD8

Rab11fip3, Rab11 family-interacting protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,047 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11fip3Q8CHD8 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab11fip3Q8CHD8 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab11fip3Q8CHD8 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab11fip3Q8CHD8 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab11fip3Q8CHD8 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab11fip3Q8CHD8 Adh4-201ENSMUST00000013458 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab11fip3Q8CHD8 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab11fip3Q8CHD8 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab11fip3Q8CHD8 AC091458.1-201ENSMUST00000220902 1361 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab11fip3Q8CHD8 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab11fip3Q8CHD8 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab11fip3Q8CHD8 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab11fip3Q8CHD8 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab11fip3Q8CHD8 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab11fip3Q8CHD8 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab11fip3Q8CHD8 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab11fip3Q8CHD8 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab11fip3Q8CHD8 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab11fip3Q8CHD8 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab11fip3Q8CHD8 Gm9062-201ENSMUST00000117712 727 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab11fip3Q8CHD8 Gm12501-201ENSMUST00000119163 529 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab11fip3Q8CHD8 Gm23085-201ENSMUST00000157849 293 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab11fip3Q8CHD8 Gm3332-201ENSMUST00000189337 928 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab11fip3Q8CHD8 Gm4482-201ENSMUST00000200876 742 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab11fip3Q8CHD8 Gm10069-203ENSMUST00000204081 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab11fip3Q8CHD8 Lysmd4-208ENSMUST00000208698 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab11fip3Q8CHD8 AC153937.1-201ENSMUST00000218734 412 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab11fip3Q8CHD8 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab11fip3Q8CHD8 Spcs1-203ENSMUST00000226374 592 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab11fip3Q8CHD8 AC133602.1-201ENSMUST00000227510 509 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab11fip3Q8CHD8 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab11fip3Q8CHD8 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab11fip3Q8CHD8 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab11fip3Q8CHD8 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab11fip3Q8CHD8 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab11fip3Q8CHD8 Gm4780-202ENSMUST00000215200 2644 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab11fip3Q8CHD8 B430119L08Rik-201ENSMUST00000130054 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab11fip3Q8CHD8 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab11fip3Q8CHD8 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab11fip3Q8CHD8 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab11fip3Q8CHD8 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab11fip3Q8CHD8 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab11fip3Q8CHD8 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab11fip3Q8CHD8 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab11fip3Q8CHD8 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab11fip3Q8CHD8 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab11fip3Q8CHD8 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab11fip3Q8CHD8 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab11fip3Q8CHD8 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab11fip3Q8CHD8 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab11fip3Q8CHD8 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab11fip3Q8CHD8 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab11fip3Q8CHD8 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab11fip3Q8CHD8 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab11fip3Q8CHD8 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab11fip3Q8CHD8 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab11fip3Q8CHD8 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab11fip3Q8CHD8 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab11fip3Q8CHD8 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab11fip3Q8CHD8 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab11fip3Q8CHD8 Timm10b-204ENSMUST00000106784 494 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab11fip3Q8CHD8 Gm13035-201ENSMUST00000117496 342 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab11fip3Q8CHD8 Gm6335-201ENSMUST00000118081 1194 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab11fip3Q8CHD8 Gm14724-201ENSMUST00000118400 537 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab11fip3Q8CHD8 Gm7816-201ENSMUST00000119884 1194 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab11fip3Q8CHD8 Gm15542-201ENSMUST00000121585 1194 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab11fip3Q8CHD8 Arid3b-204ENSMUST00000164010 1259 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab11fip3Q8CHD8 Gm5732-201ENSMUST00000182596 1007 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab11fip3Q8CHD8 Gm44968-201ENSMUST00000207652 1171 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab11fip3Q8CHD8 Net1-206ENSMUST00000222504 447 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab11fip3Q8CHD8 Tnfrsf19-203ENSMUST00000224371 1239 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab11fip3Q8CHD8 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab11fip3Q8CHD8 Lcn8-201ENSMUST00000038482 651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab11fip3Q8CHD8 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab11fip3Q8CHD8 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab11fip3Q8CHD8 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab11fip3Q8CHD8 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab11fip3Q8CHD8 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab11fip3Q8CHD8 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab11fip3Q8CHD8 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab11fip3Q8CHD8 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab11fip3Q8CHD8 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab11fip3Q8CHD8 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab11fip3Q8CHD8 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab11fip3Q8CHD8 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab11fip3Q8CHD8 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab11fip3Q8CHD8 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab11fip3Q8CHD8 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab11fip3Q8CHD8 Kif2a-202ENSMUST00000117423 2023 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab11fip3Q8CHD8 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab11fip3Q8CHD8 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab11fip3Q8CHD8 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab11fip3Q8CHD8 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab11fip3Q8CHD8 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab11fip3Q8CHD8 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab11fip3Q8CHD8 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab11fip3Q8CHD8 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab11fip3Q8CHD8 Rpl28-ps3-201ENSMUST00000116058 393 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab11fip3Q8CHD8 Gm17111-201ENSMUST00000169981 411 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab11fip3Q8CHD8 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms