Protein–RNA interactions for Protein: Q65CL1

Ctnna3, Catenin alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 895 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnna3Q65CL1 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ctnna3Q65CL1 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ctnna3Q65CL1 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ctnna3Q65CL1 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Ctnna3Q65CL1 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ctnna3Q65CL1 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ctnna3Q65CL1 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ctnna3Q65CL1 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ctnna3Q65CL1 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ctnna3Q65CL1 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ctnna3Q65CL1 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ctnna3Q65CL1 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ctnna3Q65CL1 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ctnna3Q65CL1 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ctnna3Q65CL1 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ctnna3Q65CL1 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ctnna3Q65CL1 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ctnna3Q65CL1 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Ctnna3Q65CL1 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ctnna3Q65CL1 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ctnna3Q65CL1 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ctnna3Q65CL1 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ctnna3Q65CL1 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ctnna3Q65CL1 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ctnna3Q65CL1 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ctnna3Q65CL1 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ctnna3Q65CL1 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ctnna3Q65CL1 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ctnna3Q65CL1 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ctnna3Q65CL1 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ctnna3Q65CL1 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ctnna3Q65CL1 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ctnna3Q65CL1 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ctnna3Q65CL1 Gm14028-201ENSMUST00000117434 479 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Ctnna3Q65CL1 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Ctnna3Q65CL1 Endov-204ENSMUST00000129327 1184 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Ctnna3Q65CL1 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ctnna3Q65CL1 Arf4os-201ENSMUST00000166902 566 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Ctnna3Q65CL1 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Ctnna3Q65CL1 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ctnna3Q65CL1 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Ctnna3Q65CL1 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ctnna3Q65CL1 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ctnna3Q65CL1 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ctnna3Q65CL1 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ctnna3Q65CL1 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ctnna3Q65CL1 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ctnna3Q65CL1 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ctnna3Q65CL1 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ctnna3Q65CL1 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Ctnna3Q65CL1 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ctnna3Q65CL1 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ctnna3Q65CL1 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ctnna3Q65CL1 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ctnna3Q65CL1 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ctnna3Q65CL1 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ctnna3Q65CL1 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ctnna3Q65CL1 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ctnna3Q65CL1 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ctnna3Q65CL1 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ctnna3Q65CL1 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ctnna3Q65CL1 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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Ctnna3Q65CL1 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ctnna3Q65CL1 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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Ctnna3Q65CL1 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
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Ctnna3Q65CL1 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ctnna3Q65CL1 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ctnna3Q65CL1 Gm9678-201ENSMUST00000198979 1149 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Ctnna3Q65CL1 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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Ctnna3Q65CL1 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ctnna3Q65CL1 Zfp64-201ENSMUST00000087971 2438 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ctnna3Q65CL1 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ctnna3Q65CL1 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ctnna3Q65CL1 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ctnna3Q65CL1 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ctnna3Q65CL1 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ctnna3Q65CL1 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ctnna3Q65CL1 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ctnna3Q65CL1 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ctnna3Q65CL1 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ctnna3Q65CL1 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ctnna3Q65CL1 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ctnna3Q65CL1 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ctnna3Q65CL1 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ctnna3Q65CL1 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ctnna3Q65CL1 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ctnna3Q65CL1 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ctnna3Q65CL1 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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