Protein–RNA interactions for Protein: Q60673

Ptprn, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, mousemouse

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Length 979 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprnQ60673 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PtprnQ60673 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PtprnQ60673 BC028528-202ENSMUST00000090476 809 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
PtprnQ60673 Gm10308-201ENSMUST00000095183 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
PtprnQ60673 Olfr1106-201ENSMUST00000099867 939 ntAPPRIS P1 BASIC12.4□□□□□ -0.42
PtprnQ60673 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PtprnQ60673 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
PtprnQ60673 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PtprnQ60673 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PtprnQ60673 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PtprnQ60673 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
PtprnQ60673 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
PtprnQ60673 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
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PtprnQ60673 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PtprnQ60673 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
PtprnQ60673 Gm44975-201ENSMUST00000207435 1390 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
PtprnQ60673 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PtprnQ60673 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PtprnQ60673 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
PtprnQ60673 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
PtprnQ60673 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
PtprnQ60673 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
PtprnQ60673 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
PtprnQ60673 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PtprnQ60673 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
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PtprnQ60673 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PtprnQ60673 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
PtprnQ60673 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
PtprnQ60673 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
PtprnQ60673 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PtprnQ60673 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PtprnQ60673 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PtprnQ60673 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
PtprnQ60673 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PtprnQ60673 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PtprnQ60673 Olfr647-ps1-201ENSMUST00000121599 960 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
PtprnQ60673 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PtprnQ60673 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PtprnQ60673 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
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PtprnQ60673 Tnnt1-213ENSMUST00000178163 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
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PtprnQ60673 Mir6927-201ENSMUST00000184494 71 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
PtprnQ60673 Gm37684-201ENSMUST00000192779 355 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
PtprnQ60673 Gm37638-201ENSMUST00000194337 1123 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
PtprnQ60673 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
PtprnQ60673 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PtprnQ60673 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
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PtprnQ60673 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PtprnQ60673 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PtprnQ60673 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PtprnQ60673 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PtprnQ60673 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PtprnQ60673 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
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PtprnQ60673 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PtprnQ60673 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
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PtprnQ60673 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
PtprnQ60673 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
PtprnQ60673 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
PtprnQ60673 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
PtprnQ60673 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
PtprnQ60673 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
PtprnQ60673 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
PtprnQ60673 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
PtprnQ60673 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
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PtprnQ60673 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
PtprnQ60673 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
PtprnQ60673 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
PtprnQ60673 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
PtprnQ60673 Gm25732-201ENSMUST00000175168 60 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
PtprnQ60673 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
PtprnQ60673 Gm16617-201ENSMUST00000181008 675 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
PtprnQ60673 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
PtprnQ60673 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
PtprnQ60673 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
PtprnQ60673 Gm18660-201ENSMUST00000199542 629 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
PtprnQ60673 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
PtprnQ60673 Olfr838-ps1-201ENSMUST00000211872 977 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.8 ms