Protein–RNA interactions for Protein: Q4FZC9

Syne3, Nesprin-3, mousemouse

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Length 975 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syne3Q4FZC9 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Syne3Q4FZC9 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Syne3Q4FZC9 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Syne3Q4FZC9 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Syne3Q4FZC9 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Syne3Q4FZC9 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Syne3Q4FZC9 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Syne3Q4FZC9 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Syne3Q4FZC9 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Syne3Q4FZC9 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Syne3Q4FZC9 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Syne3Q4FZC9 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Syne3Q4FZC9 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Syne3Q4FZC9 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Syne3Q4FZC9 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Syne3Q4FZC9 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Syne3Q4FZC9 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Syne3Q4FZC9 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Syne3Q4FZC9 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Syne3Q4FZC9 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Syne3Q4FZC9 Acacb-201ENSMUST00000031583 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Syne3Q4FZC9 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Syne3Q4FZC9 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Syne3Q4FZC9 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Syne3Q4FZC9 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Syne3Q4FZC9 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Syne3Q4FZC9 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Syne3Q4FZC9 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Syne3Q4FZC9 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Syne3Q4FZC9 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Syne3Q4FZC9 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Syne3Q4FZC9 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Syne3Q4FZC9 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Syne3Q4FZC9 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Syne3Q4FZC9 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Syne3Q4FZC9 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Syne3Q4FZC9 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Syne3Q4FZC9 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Syne3Q4FZC9 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Syne3Q4FZC9 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Syne3Q4FZC9 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Syne3Q4FZC9 Armt1-203ENSMUST00000118544 5044 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Syne3Q4FZC9 Tenm3-206ENSMUST00000190840 8663 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Syne3Q4FZC9 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Syne3Q4FZC9 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Syne3Q4FZC9 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Syne3Q4FZC9 Zbtb44-201ENSMUST00000115222 8861 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Syne3Q4FZC9 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Syne3Q4FZC9 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Syne3Q4FZC9 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Syne3Q4FZC9 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Syne3Q4FZC9 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Syne3Q4FZC9 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Syne3Q4FZC9 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Syne3Q4FZC9 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Syne3Q4FZC9 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Syne3Q4FZC9 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Syne3Q4FZC9 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Syne3Q4FZC9 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Syne3Q4FZC9 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Syne3Q4FZC9 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Syne3Q4FZC9 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Syne3Q4FZC9 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Syne3Q4FZC9 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Syne3Q4FZC9 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Syne3Q4FZC9 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Syne3Q4FZC9 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Syne3Q4FZC9 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Syne3Q4FZC9 Dmbt1-206ENSMUST00000213064 5779 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Syne3Q4FZC9 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Syne3Q4FZC9 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Syne3Q4FZC9 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Syne3Q4FZC9 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Syne3Q4FZC9 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Syne3Q4FZC9 Dpysl5-201ENSMUST00000088081 5022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Syne3Q4FZC9 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Syne3Q4FZC9 Cald1-205ENSMUST00000115027 4777 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Syne3Q4FZC9 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Syne3Q4FZC9 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Syne3Q4FZC9 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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