Protein–RNA interactions for Protein: Q3UWL8

Pfdn4, Prefoldin subunit 4, mousemouse

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Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn4Q3UWL8 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Pfdn4Q3UWL8 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Pfdn4Q3UWL8 Slc17a5-202ENSMUST00000117645 3114 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Pfdn4Q3UWL8 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Pfdn4Q3UWL8 Rab3c-202ENSMUST00000223922 2398 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Pfdn4Q3UWL8 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Pfdn4Q3UWL8 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Pfdn4Q3UWL8 Grm1-202ENSMUST00000105560 4265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Pfdn4Q3UWL8 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Pfdn4Q3UWL8 Zc3h18-205ENSMUST00000176629 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Pfdn4Q3UWL8 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Pfdn4Q3UWL8 Abcc10-204ENSMUST00000167360 4866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pfdn4Q3UWL8 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pfdn4Q3UWL8 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pfdn4Q3UWL8 Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 6961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pfdn4Q3UWL8 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pfdn4Q3UWL8 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pfdn4Q3UWL8 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pfdn4Q3UWL8 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pfdn4Q3UWL8 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pfdn4Q3UWL8 Iqgap3-201ENSMUST00000071812 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pfdn4Q3UWL8 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pfdn4Q3UWL8 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pfdn4Q3UWL8 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pfdn4Q3UWL8 Dbx2-201ENSMUST00000054244 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pfdn4Q3UWL8 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Pfdn4Q3UWL8 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pfdn4Q3UWL8 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pfdn4Q3UWL8 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Pfdn4Q3UWL8 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pfdn4Q3UWL8 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pfdn4Q3UWL8 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pfdn4Q3UWL8 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Pfdn4Q3UWL8 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Pfdn4Q3UWL8 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Pfdn4Q3UWL8 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Pfdn4Q3UWL8 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pfdn4Q3UWL8 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pfdn4Q3UWL8 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pfdn4Q3UWL8 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pfdn4Q3UWL8 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pfdn4Q3UWL8 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pfdn4Q3UWL8 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pfdn4Q3UWL8 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pfdn4Q3UWL8 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pfdn4Q3UWL8 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pfdn4Q3UWL8 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pfdn4Q3UWL8 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pfdn4Q3UWL8 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pfdn4Q3UWL8 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pfdn4Q3UWL8 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pfdn4Q3UWL8 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pfdn4Q3UWL8 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pfdn4Q3UWL8 Astn1-209ENSMUST00000194369 3344 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pfdn4Q3UWL8 Atic-201ENSMUST00000027384 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pfdn4Q3UWL8 Mfrp-201ENSMUST00000034654 4316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pfdn4Q3UWL8 Bmp3-203ENSMUST00000200388 6609 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pfdn4Q3UWL8 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pfdn4Q3UWL8 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Pfdn4Q3UWL8 Magel2-201ENSMUST00000080403 4631 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pfdn4Q3UWL8 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pfdn4Q3UWL8 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pfdn4Q3UWL8 Mbtps1-201ENSMUST00000081381 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pfdn4Q3UWL8 Slc46a2-201ENSMUST00000030081 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pfdn4Q3UWL8 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pfdn4Q3UWL8 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pfdn4Q3UWL8 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pfdn4Q3UWL8 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Pfdn4Q3UWL8 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
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Pfdn4Q3UWL8 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pfdn4Q3UWL8 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pfdn4Q3UWL8 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pfdn4Q3UWL8 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Pfdn4Q3UWL8 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pfdn4Q3UWL8 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pfdn4Q3UWL8 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pfdn4Q3UWL8 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pfdn4Q3UWL8 Pbrm1-208ENSMUST00000112098 6566 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pfdn4Q3UWL8 Mtf1-202ENSMUST00000106193 7554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pfdn4Q3UWL8 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pfdn4Q3UWL8 Ippk-201ENSMUST00000021817 2856 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pfdn4Q3UWL8 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pfdn4Q3UWL8 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pfdn4Q3UWL8 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pfdn4Q3UWL8 Gon4l-203ENSMUST00000107498 7537 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pfdn4Q3UWL8 Fli1-201ENSMUST00000016231 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pfdn4Q3UWL8 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pfdn4Q3UWL8 Gm29050-201ENSMUST00000190732 2528 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pfdn4Q3UWL8 Fen1-202ENSMUST00000116542 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pfdn4Q3UWL8 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pfdn4Q3UWL8 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pfdn4Q3UWL8 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pfdn4Q3UWL8 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pfdn4Q3UWL8 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pfdn4Q3UWL8 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pfdn4Q3UWL8 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pfdn4Q3UWL8 Zfp597-201ENSMUST00000090522 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pfdn4Q3UWL8 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
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