Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHB8

Ccdc177, Coiled-coil domain-containing protein 177, mousemouse

Predictions only

Length 706 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc177Q3UHB8 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ccdc177Q3UHB8 Npr2-201ENSMUST00000030191 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ccdc177Q3UHB8 Ranbp10-201ENSMUST00000041400 5308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ccdc177Q3UHB8 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ccdc177Q3UHB8 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ccdc177Q3UHB8 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ccdc177Q3UHB8 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ccdc177Q3UHB8 Rxra-206ENSMUST00000166775 3216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ccdc177Q3UHB8 Gm9466-201ENSMUST00000218144 2246 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Ccdc177Q3UHB8 Ces2a-201ENSMUST00000034346 1960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ccdc177Q3UHB8 Mecom-202ENSMUST00000108270 5692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ccdc177Q3UHB8 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ccdc177Q3UHB8 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ccdc177Q3UHB8 Tfr2-201ENSMUST00000031729 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ccdc177Q3UHB8 Enox1-203ENSMUST00000227662 3064 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ccdc177Q3UHB8 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Ccdc177Q3UHB8 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ccdc177Q3UHB8 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ccdc177Q3UHB8 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ccdc177Q3UHB8 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ccdc177Q3UHB8 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Ccdc177Q3UHB8 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ccdc177Q3UHB8 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ccdc177Q3UHB8 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ccdc177Q3UHB8 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ccdc177Q3UHB8 Ccdc57-201ENSMUST00000056781 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ccdc177Q3UHB8 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ccdc177Q3UHB8 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ccdc177Q3UHB8 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ccdc177Q3UHB8 Col9a1-202ENSMUST00000088349 3059 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ccdc177Q3UHB8 Igsf1-204ENSMUST00000114893 2671 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ccdc177Q3UHB8 Zscan10-201ENSMUST00000095595 2698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ccdc177Q3UHB8 Gfra1-209ENSMUST00000169850 3224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ccdc177Q3UHB8 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ccdc177Q3UHB8 Extl3-201ENSMUST00000022550 5977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ccdc177Q3UHB8 Mob4-205ENSMUST00000162364 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ccdc177Q3UHB8 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ccdc177Q3UHB8 Slc39a14-202ENSMUST00000068044 4926 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ccdc177Q3UHB8 Ntng2-202ENSMUST00000071201 1881 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ccdc177Q3UHB8 Smtn-203ENSMUST00000075118 3117 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ccdc177Q3UHB8 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ccdc177Q3UHB8 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ccdc177Q3UHB8 Nfic-203ENSMUST00000105321 6237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ccdc177Q3UHB8 Pex11g-201ENSMUST00000004686 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ccdc177Q3UHB8 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ccdc177Q3UHB8 Fam172a-201ENSMUST00000091459 3892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ccdc177Q3UHB8 Gtf3c1-204ENSMUST00000205659 6570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ccdc177Q3UHB8 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ccdc177Q3UHB8 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ccdc177Q3UHB8 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ccdc177Q3UHB8 Mark3-208ENSMUST00000221753 2394 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ccdc177Q3UHB8 Cyb5r3-202ENSMUST00000162178 2547 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ccdc177Q3UHB8 Trpv1-203ENSMUST00000108470 2667 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ccdc177Q3UHB8 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ccdc177Q3UHB8 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ccdc177Q3UHB8 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ccdc177Q3UHB8 Gm43931-201ENSMUST00000204817 2870 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Ccdc177Q3UHB8 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ccdc177Q3UHB8 Ica1-204ENSMUST00000115520 1876 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ccdc177Q3UHB8 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Ccdc177Q3UHB8 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Ccdc177Q3UHB8 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ccdc177Q3UHB8 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ccdc177Q3UHB8 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ccdc177Q3UHB8 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ccdc177Q3UHB8 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Ccdc177Q3UHB8 Gm42141-201ENSMUST00000196534 2172 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Ccdc177Q3UHB8 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ccdc177Q3UHB8 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ccdc177Q3UHB8 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ccdc177Q3UHB8 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ccdc177Q3UHB8 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ccdc177Q3UHB8 Mfsd4b5-202ENSMUST00000073618 2978 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ccdc177Q3UHB8 Asb8-204ENSMUST00000143400 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ccdc177Q3UHB8 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ccdc177Q3UHB8 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ccdc177Q3UHB8 Zfp251-201ENSMUST00000080406 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ccdc177Q3UHB8 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ccdc177Q3UHB8 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ccdc177Q3UHB8 Tmod2-201ENSMUST00000064433 9884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ccdc177Q3UHB8 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ccdc177Q3UHB8 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ccdc177Q3UHB8 Tpx2-201ENSMUST00000028969 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ccdc177Q3UHB8 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ccdc177Q3UHB8 Furin-201ENSMUST00000107362 4166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ccdc177Q3UHB8 Kirrel3-209ENSMUST00000190549 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ccdc177Q3UHB8 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ccdc177Q3UHB8 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ccdc177Q3UHB8 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ccdc177Q3UHB8 Zcchc8-204ENSMUST00000196282 4350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ccdc177Q3UHB8 Agpat3-211ENSMUST00000166360 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ccdc177Q3UHB8 Ces2d-ps-201ENSMUST00000043209 1656 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Ccdc177Q3UHB8 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ccdc177Q3UHB8 Epha6-201ENSMUST00000068860 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ccdc177Q3UHB8 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ccdc177Q3UHB8 Dna2-203ENSMUST00000131422 4122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ccdc177Q3UHB8 Casc1-203ENSMUST00000111728 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ccdc177Q3UHB8 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ccdc177Q3UHB8 Kalrn-206ENSMUST00000114954 4677 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ccdc177Q3UHB8 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87 ms