Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIR1

Trappc13, Trafficking protein particle complex subunit 13, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc13Q3TIR1 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Trappc13Q3TIR1 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Trappc13Q3TIR1 Trpv3-201ENSMUST00000049676 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Trappc13Q3TIR1 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Trappc13Q3TIR1 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Trappc13Q3TIR1 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Trappc13Q3TIR1 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Trappc13Q3TIR1 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Trappc13Q3TIR1 Pop4-201ENSMUST00000032585 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Trappc13Q3TIR1 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Trappc13Q3TIR1 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Trappc13Q3TIR1 Epb41l1-206ENSMUST00000109577 6251 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Trappc13Q3TIR1 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Trappc13Q3TIR1 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Trappc13Q3TIR1 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Trappc13Q3TIR1 Epha5-206ENSMUST00000113406 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Trappc13Q3TIR1 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Trappc13Q3TIR1 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Trappc13Q3TIR1 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Trappc13Q3TIR1 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Trappc13Q3TIR1 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Trappc13Q3TIR1 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Trappc13Q3TIR1 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Trappc13Q3TIR1 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Trappc13Q3TIR1 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Trappc13Q3TIR1 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Trappc13Q3TIR1 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Trappc13Q3TIR1 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Trappc13Q3TIR1 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Trappc13Q3TIR1 Abcc10-201ENSMUST00000047970 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Trappc13Q3TIR1 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Trappc13Q3TIR1 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Trappc13Q3TIR1 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Trappc13Q3TIR1 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Trappc13Q3TIR1 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Trappc13Q3TIR1 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Trappc13Q3TIR1 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Trappc13Q3TIR1 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Trappc13Q3TIR1 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Trappc13Q3TIR1 AC164426.2-201ENSMUST00000225993 2492 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Trappc13Q3TIR1 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Trappc13Q3TIR1 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Trappc13Q3TIR1 Mtr-201ENSMUST00000099856 8294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Trappc13Q3TIR1 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Trappc13Q3TIR1 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Trappc13Q3TIR1 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Trappc13Q3TIR1 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Trappc13Q3TIR1 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Trappc13Q3TIR1 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Trappc13Q3TIR1 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Trappc13Q3TIR1 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Trappc13Q3TIR1 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Trappc13Q3TIR1 Tmx3-201ENSMUST00000025515 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Trappc13Q3TIR1 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Trappc13Q3TIR1 Tnn-202ENSMUST00000131919 3987 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Trappc13Q3TIR1 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Trappc13Q3TIR1 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Trappc13Q3TIR1 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Trappc13Q3TIR1 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Trappc13Q3TIR1 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Trappc13Q3TIR1 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Trappc13Q3TIR1 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Trappc13Q3TIR1 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Trappc13Q3TIR1 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Trappc13Q3TIR1 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Trappc13Q3TIR1 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Trappc13Q3TIR1 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Trappc13Q3TIR1 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Trappc13Q3TIR1 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Trappc13Q3TIR1 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Trappc13Q3TIR1 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Trappc13Q3TIR1 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Trappc13Q3TIR1 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Trappc13Q3TIR1 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Trappc13Q3TIR1 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Trappc13Q3TIR1 Sec16a-202ENSMUST00000114082 8797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Trappc13Q3TIR1 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Trappc13Q3TIR1 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Trappc13Q3TIR1 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Trappc13Q3TIR1 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Trappc13Q3TIR1 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Trappc13Q3TIR1 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Trappc13Q3TIR1 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Trappc13Q3TIR1 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Trappc13Q3TIR1 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Trappc13Q3TIR1 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Trappc13Q3TIR1 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Trappc13Q3TIR1 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Trappc13Q3TIR1 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Trappc13Q3TIR1 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Trappc13Q3TIR1 Col18a1-203ENSMUST00000105409 4791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Trappc13Q3TIR1 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Trappc13Q3TIR1 Pcdhgb5-201ENSMUST00000192535 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Trappc13Q3TIR1 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Trappc13Q3TIR1 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Trappc13Q3TIR1 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Trappc13Q3TIR1 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Trappc13Q3TIR1 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Trappc13Q3TIR1 Kif1a-201ENSMUST00000086819 5097 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Trappc13Q3TIR1 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms