Protein–RNA interactions for Protein: Q3LRV9

Treml4, Trem-like transcript 4 protein, mousemouse

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Length 263 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Treml4Q3LRV9 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Treml4Q3LRV9 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Treml4Q3LRV9 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Treml4Q3LRV9 Gm10110-202ENSMUST00000228705 3220 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Treml4Q3LRV9 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Treml4Q3LRV9 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Treml4Q3LRV9 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Treml4Q3LRV9 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Treml4Q3LRV9 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Treml4Q3LRV9 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Treml4Q3LRV9 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Treml4Q3LRV9 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Treml4Q3LRV9 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Treml4Q3LRV9 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Treml4Q3LRV9 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Treml4Q3LRV9 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Treml4Q3LRV9 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Treml4Q3LRV9 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Treml4Q3LRV9 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Treml4Q3LRV9 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Treml4Q3LRV9 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Treml4Q3LRV9 Tm2d3-203ENSMUST00000107495 1003 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Treml4Q3LRV9 Fen1-202ENSMUST00000116542 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Treml4Q3LRV9 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Treml4Q3LRV9 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Treml4Q3LRV9 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Treml4Q3LRV9 Gm28982-201ENSMUST00000186895 512 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Treml4Q3LRV9 1700119H24Rik-201ENSMUST00000187558 588 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Treml4Q3LRV9 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Treml4Q3LRV9 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Treml4Q3LRV9 Gm37666-201ENSMUST00000194110 866 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Treml4Q3LRV9 Gm7003-201ENSMUST00000195089 312 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Treml4Q3LRV9 Gm21057-202ENSMUST00000206111 512 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Treml4Q3LRV9 Gm2511-202ENSMUST00000206158 455 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Treml4Q3LRV9 Gm44968-201ENSMUST00000207652 1171 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Treml4Q3LRV9 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Treml4Q3LRV9 Pf4-201ENSMUST00000031320 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Treml4Q3LRV9 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Treml4Q3LRV9 Nudt7-201ENSMUST00000066514 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Treml4Q3LRV9 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Treml4Q3LRV9 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Treml4Q3LRV9 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Treml4Q3LRV9 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Treml4Q3LRV9 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Treml4Q3LRV9 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Treml4Q3LRV9 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Treml4Q3LRV9 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Treml4Q3LRV9 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Treml4Q3LRV9 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Treml4Q3LRV9 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Treml4Q3LRV9 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Treml4Q3LRV9 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Treml4Q3LRV9 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Treml4Q3LRV9 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Treml4Q3LRV9 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Treml4Q3LRV9 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Treml4Q3LRV9 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Treml4Q3LRV9 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Treml4Q3LRV9 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Treml4Q3LRV9 Cd40-201ENSMUST00000017799 2986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Treml4Q3LRV9 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Treml4Q3LRV9 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Treml4Q3LRV9 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Treml4Q3LRV9 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Treml4Q3LRV9 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Treml4Q3LRV9 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Treml4Q3LRV9 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Treml4Q3LRV9 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Treml4Q3LRV9 Tmed5-203ENSMUST00000117759 482 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Treml4Q3LRV9 BC026585-202ENSMUST00000119891 1125 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Treml4Q3LRV9 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Treml4Q3LRV9 Chtf8-203ENSMUST00000176090 615 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Treml4Q3LRV9 7530416G11Rik-201ENSMUST00000178942 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Treml4Q3LRV9 Gm5732-201ENSMUST00000182596 1007 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Treml4Q3LRV9 Nr1h2-ps-201ENSMUST00000183844 478 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Treml4Q3LRV9 5330413P13Rik-205ENSMUST00000210961 913 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Treml4Q3LRV9 Gm45770-201ENSMUST00000212105 616 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Treml4Q3LRV9 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Treml4Q3LRV9 Ufc1-201ENSMUST00000080001 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Treml4Q3LRV9 Smtn-202ENSMUST00000020721 3335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Treml4Q3LRV9 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Treml4Q3LRV9 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Treml4Q3LRV9 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Treml4Q3LRV9 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Treml4Q3LRV9 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Treml4Q3LRV9 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Treml4Q3LRV9 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Treml4Q3LRV9 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Treml4Q3LRV9 Spata48-201ENSMUST00000020410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Treml4Q3LRV9 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Treml4Q3LRV9 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Treml4Q3LRV9 Sparc-209ENSMUST00000216313 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Treml4Q3LRV9 Rnf133-201ENSMUST00000063548 1308 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Treml4Q3LRV9 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Treml4Q3LRV9 Vps16-201ENSMUST00000028900 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Treml4Q3LRV9 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Treml4Q3LRV9 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Treml4Q3LRV9 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Treml4Q3LRV9 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Treml4Q3LRV9 AC211878.3-201ENSMUST00000222629 2018 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
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