Protein–RNA interactions for Protein: Q02738

Gjb4, Gap junction beta-4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb4Q02738 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gjb4Q02738 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gjb4Q02738 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gjb4Q02738 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gjb4Q02738 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Gjb4Q02738 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gjb4Q02738 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gjb4Q02738 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gjb4Q02738 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gjb4Q02738 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Gjb4Q02738 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gjb4Q02738 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gjb4Q02738 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gjb4Q02738 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gjb4Q02738 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gjb4Q02738 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gjb4Q02738 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Gjb4Q02738 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Gjb4Q02738 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Gjb4Q02738 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
Gjb4Q02738 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Gjb4Q02738 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC13.83□□□□□ -0.19
Gjb4Q02738 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gjb4Q02738 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gjb4Q02738 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gjb4Q02738 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gjb4Q02738 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gjb4Q02738 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gjb4Q02738 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gjb4Q02738 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gjb4Q02738 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Gjb4Q02738 Gm12164-201ENSMUST00000121695 551 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Gjb4Q02738 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Gjb4Q02738 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gjb4Q02738 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gjb4Q02738 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Gjb4Q02738 Gm38317-201ENSMUST00000195564 343 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Gjb4Q02738 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gjb4Q02738 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gjb4Q02738 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gjb4Q02738 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gjb4Q02738 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gjb4Q02738 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gjb4Q02738 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gjb4Q02738 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gjb4Q02738 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gjb4Q02738 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gjb4Q02738 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gjb4Q02738 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gjb4Q02738 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gjb4Q02738 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gjb4Q02738 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gjb4Q02738 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gjb4Q02738 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gjb4Q02738 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gjb4Q02738 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gjb4Q02738 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gjb4Q02738 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gjb4Q02738 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gjb4Q02738 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gjb4Q02738 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gjb4Q02738 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gjb4Q02738 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gjb4Q02738 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Gjb4Q02738 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gjb4Q02738 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gjb4Q02738 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gjb4Q02738 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gjb4Q02738 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gjb4Q02738 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gjb4Q02738 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gjb4Q02738 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gjb4Q02738 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gjb4Q02738 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gjb4Q02738 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gjb4Q02738 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gjb4Q02738 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gjb4Q02738 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gjb4Q02738 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gjb4Q02738 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Gjb4Q02738 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gjb4Q02738 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gjb4Q02738 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gjb4Q02738 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gjb4Q02738 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gjb4Q02738 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gjb4Q02738 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gjb4Q02738 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gjb4Q02738 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gjb4Q02738 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gjb4Q02738 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gjb4Q02738 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gjb4Q02738 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gjb4Q02738 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gjb4Q02738 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gjb4Q02738 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gjb4Q02738 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gjb4Q02738 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gjb4Q02738 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gjb4Q02738 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms