Protein–RNA interactions for Protein: P49446

Ptpre, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, mousemouse

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Length 699 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpreP49446 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
PtpreP49446 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
PtpreP49446 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
PtpreP49446 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
PtpreP49446 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
PtpreP49446 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC13.77□□□□□ -0.2
PtpreP49446 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
PtpreP49446 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PtpreP49446 Krtap4-8-201ENSMUST00000107439 983 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
PtpreP49446 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
PtpreP49446 Gm15972-201ENSMUST00000132571 418 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
PtpreP49446 Gm53-203ENSMUST00000143887 757 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
PtpreP49446 U2af1l4-234ENSMUST00000171850 564 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
PtpreP49446 Gm21859-201ENSMUST00000178424 1045 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PtpreP49446 Rps13-ps2-201ENSMUST00000182017 453 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
PtpreP49446 Gm28975-201ENSMUST00000186412 686 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
PtpreP49446 Gm9540-201ENSMUST00000188230 478 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
PtpreP49446 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PtpreP49446 Gm7600-201ENSMUST00000209657 785 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
PtpreP49446 Ccdc153-202ENSMUST00000213891 792 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
PtpreP49446 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
PtpreP49446 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
PtpreP49446 9530020I12Rik-203ENSMUST00000219371 819 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
PtpreP49446 Gm40576-201ENSMUST00000221773 1152 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
PtpreP49446 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
PtpreP49446 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PtpreP49446 Ndufb4-201ENSMUST00000023514 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PtpreP49446 Thegl-201ENSMUST00000031161 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PtpreP49446 Rln1-201ENSMUST00000044143 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PtpreP49446 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PtpreP49446 Daw1-201ENSMUST00000065403 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
PtpreP49446 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PtpreP49446 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PtpreP49446 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PtpreP49446 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PtpreP49446 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PtpreP49446 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PtpreP49446 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PtpreP49446 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PtpreP49446 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PtpreP49446 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PtpreP49446 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PtpreP49446 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PtpreP49446 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PtpreP49446 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
PtpreP49446 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PtpreP49446 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PtpreP49446 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PtpreP49446 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PtpreP49446 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PtpreP49446 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PtpreP49446 Srsf5-202ENSMUST00000110351 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PtpreP49446 Cdc42ep2-201ENSMUST00000055458 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PtpreP49446 Gm43435-201ENSMUST00000199996 1438 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
PtpreP49446 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PtpreP49446 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PtpreP49446 Adh4-201ENSMUST00000013458 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PtpreP49446 Susd3-201ENSMUST00000021816 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PtpreP49446 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PtpreP49446 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PtpreP49446 Ppil6-201ENSMUST00000105507 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PtpreP49446 Aamdc-213ENSMUST00000154853 883 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PtpreP49446 Csnk1a1-208ENSMUST00000167187 1222 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PtpreP49446 Gm18595-201ENSMUST00000175736 1068 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
PtpreP49446 Plac9a-202ENSMUST00000183431 536 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PtpreP49446 1110008E08Rik-202ENSMUST00000183621 723 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
PtpreP49446 Plac9b-204ENSMUST00000184675 536 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PtpreP49446 Stpg4-202ENSMUST00000186211 591 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
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PtpreP49446 Ighv4-2-201ENSMUST00000192975 362 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
PtpreP49446 Gm10069-203ENSMUST00000204081 907 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PtpreP49446 Hrc-202ENSMUST00000211327 607 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PtpreP49446 AC102542.1-201ENSMUST00000225204 1138 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
PtpreP49446 Cmtm2b-201ENSMUST00000041973 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PtpreP49446 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PtpreP49446 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PtpreP49446 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PtpreP49446 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PtpreP49446 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PtpreP49446 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PtpreP49446 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PtpreP49446 Etv1-211ENSMUST00000162563 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PtpreP49446 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PtpreP49446 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PtpreP49446 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PtpreP49446 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PtpreP49446 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PtpreP49446 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PtpreP49446 CT030159.3-201ENSMUST00000222936 1481 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PtpreP49446 5330439B14Rik-201ENSMUST00000194811 1392 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PtpreP49446 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PtpreP49446 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PtpreP49446 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PtpreP49446 Gm23596-201ENSMUST00000104304 132 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
PtpreP49446 S100a16-206ENSMUST00000107335 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PtpreP49446 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PtpreP49446 4930583K01Rik-201ENSMUST00000138180 925 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PtpreP49446 Scgb1b19-201ENSMUST00000165813 418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PtpreP49446 Scgb1b3-201ENSMUST00000179481 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PtpreP49446 Zfp229-206ENSMUST00000183192 653 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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