Protein–RNA interactions for Protein: P43117

Ptgfr, Prostaglandin F2-alpha receptor, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtgfrP43117 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
PtgfrP43117 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
PtgfrP43117 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
PtgfrP43117 Arap1-202ENSMUST00000084896 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
PtgfrP43117 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
PtgfrP43117 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
PtgfrP43117 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
PtgfrP43117 Dab2ip-207ENSMUST00000112992 6184 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
PtgfrP43117 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
PtgfrP43117 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
PtgfrP43117 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
PtgfrP43117 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
PtgfrP43117 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
PtgfrP43117 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
PtgfrP43117 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
PtgfrP43117 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
PtgfrP43117 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
PtgfrP43117 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
PtgfrP43117 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
PtgfrP43117 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
PtgfrP43117 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
PtgfrP43117 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
PtgfrP43117 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
PtgfrP43117 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
PtgfrP43117 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
PtgfrP43117 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
PtgfrP43117 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
PtgfrP43117 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
PtgfrP43117 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC10.56□□□□□ -0.72
PtgfrP43117 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
PtgfrP43117 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
PtgfrP43117 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
PtgfrP43117 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
PtgfrP43117 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
PtgfrP43117 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
PtgfrP43117 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
PtgfrP43117 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
PtgfrP43117 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
PtgfrP43117 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
PtgfrP43117 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
PtgfrP43117 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
PtgfrP43117 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
PtgfrP43117 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
PtgfrP43117 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
PtgfrP43117 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
PtgfrP43117 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
PtgfrP43117 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
PtgfrP43117 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
PtgfrP43117 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
PtgfrP43117 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
PtgfrP43117 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
PtgfrP43117 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
PtgfrP43117 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
PtgfrP43117 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
PtgfrP43117 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
PtgfrP43117 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
PtgfrP43117 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
PtgfrP43117 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
PtgfrP43117 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
PtgfrP43117 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
PtgfrP43117 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
PtgfrP43117 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
PtgfrP43117 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
PtgfrP43117 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
PtgfrP43117 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
PtgfrP43117 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
PtgfrP43117 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
PtgfrP43117 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
PtgfrP43117 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
PtgfrP43117 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
PtgfrP43117 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
PtgfrP43117 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
PtgfrP43117 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
PtgfrP43117 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
PtgfrP43117 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
PtgfrP43117 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
PtgfrP43117 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
PtgfrP43117 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
PtgfrP43117 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
PtgfrP43117 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
PtgfrP43117 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
PtgfrP43117 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
PtgfrP43117 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
PtgfrP43117 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
PtgfrP43117 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
PtgfrP43117 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
PtgfrP43117 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
PtgfrP43117 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
PtgfrP43117 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
PtgfrP43117 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
PtgfrP43117 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
PtgfrP43117 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
PtgfrP43117 Armt1-203ENSMUST00000118544 5044 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
PtgfrP43117 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
PtgfrP43117 Gm43727-201ENSMUST00000198021 2647 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
PtgfrP43117 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
PtgfrP43117 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
PtgfrP43117 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
PtgfrP43117 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
PtgfrP43117 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms