Protein–RNA interactions for Protein: P42209

Sept1, Septin-1, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sept1P42209 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Sept1P42209 Spata48-201ENSMUST00000020410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
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Sept1P42209 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sept1P42209 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sept1P42209 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sept1P42209 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sept1P42209 Mir680-2-201ENSMUST00000102163 110 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Sept1P42209 Gm23251-201ENSMUST00000103773 110 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Sept1P42209 Gm9062-201ENSMUST00000117712 727 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
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Sept1P42209 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sept1P42209 Gm5732-201ENSMUST00000182596 1007 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Sept1P42209 Gm28375-201ENSMUST00000185304 430 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sept1P42209 A630035G10Rik-202ENSMUST00000194468 1065 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sept1P42209 Gm35986-201ENSMUST00000197370 655 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sept1P42209 Gm42682-201ENSMUST00000198349 1265 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Sept1P42209 Gm42997-202ENSMUST00000200321 985 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
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