Protein–RNA interactions for Protein: P30548

Tacr1, Substance-P receptor, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tacr1P30548 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Tacr1P30548 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Tacr1P30548 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Tacr1P30548 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Tacr1P30548 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Tacr1P30548 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Tacr1P30548 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Tacr1P30548 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Tacr1P30548 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Tacr1P30548 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Tacr1P30548 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Tacr1P30548 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Tacr1P30548 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Tacr1P30548 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Tacr1P30548 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Tacr1P30548 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Tacr1P30548 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Tacr1P30548 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Tacr1P30548 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Tacr1P30548 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Tacr1P30548 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Tacr1P30548 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Tacr1P30548 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Tacr1P30548 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Tacr1P30548 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Tacr1P30548 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Tacr1P30548 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Tacr1P30548 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Tacr1P30548 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Tacr1P30548 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Tacr1P30548 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Tacr1P30548 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Tacr1P30548 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Tacr1P30548 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Tacr1P30548 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Tacr1P30548 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Tacr1P30548 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Tacr1P30548 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Tacr1P30548 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Tacr1P30548 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Tacr1P30548 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Tacr1P30548 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Tacr1P30548 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Tacr1P30548 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Tacr1P30548 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Tacr1P30548 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Tacr1P30548 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Tacr1P30548 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Tacr1P30548 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Tacr1P30548 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Tacr1P30548 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Tacr1P30548 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Tacr1P30548 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Tacr1P30548 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Tacr1P30548 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Tacr1P30548 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Tacr1P30548 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Tacr1P30548 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Tacr1P30548 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Tacr1P30548 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tacr1P30548 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tacr1P30548 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tacr1P30548 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Tacr1P30548 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tacr1P30548 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tacr1P30548 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tacr1P30548 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Tacr1P30548 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tacr1P30548 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Tacr1P30548 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tacr1P30548 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tacr1P30548 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tacr1P30548 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tacr1P30548 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Tacr1P30548 Gm12953-201ENSMUST00000138426 751 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tacr1P30548 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tacr1P30548 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Tacr1P30548 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tacr1P30548 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tacr1P30548 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Tacr1P30548 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Tacr1P30548 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tacr1P30548 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tacr1P30548 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tacr1P30548 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tacr1P30548 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tacr1P30548 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tacr1P30548 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tacr1P30548 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tacr1P30548 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tacr1P30548 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tacr1P30548 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tacr1P30548 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tacr1P30548 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tacr1P30548 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tacr1P30548 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tacr1P30548 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tacr1P30548 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tacr1P30548 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tacr1P30548 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms