Protein–RNA interactions for Protein: O35740

Cited2, Cbp/p300-interacting transactivator 2, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cited2O35740 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Cited2O35740 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Cited2O35740 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Cited2O35740 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Cited2O35740 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Cited2O35740 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Cited2O35740 Plin4-201ENSMUST00000002908 5755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Cited2O35740 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Cited2O35740 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Cited2O35740 Rassf4-201ENSMUST00000035842 6460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Cited2O35740 Bcl2l2-203ENSMUST00000133397 3813 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Cited2O35740 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Cited2O35740 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Cited2O35740 Fen1-202ENSMUST00000116542 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Cited2O35740 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Cited2O35740 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Cited2O35740 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC10.02□□□□□ -0.8
Cited2O35740 Slc35a4-206ENSMUST00000186538 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Cited2O35740 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Cited2O35740 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Cited2O35740 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Cited2O35740 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Cited2O35740 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Cited2O35740 Ablim1-211ENSMUST00000111555 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Cited2O35740 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Cited2O35740 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Cited2O35740 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Cited2O35740 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Cited2O35740 Vmn1r38-202ENSMUST00000227493 3486 ntAPPRIS P1 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Cited2O35740 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Cited2O35740 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Cited2O35740 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Cited2O35740 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Cited2O35740 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Cited2O35740 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Cited2O35740 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Cited2O35740 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Cited2O35740 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Cited2O35740 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Cited2O35740 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Cited2O35740 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Cited2O35740 Mthfr-201ENSMUST00000069604 6072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Cited2O35740 Arhgap24-202ENSMUST00000073302 3151 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Cited2O35740 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Cited2O35740 Plagl2-201ENSMUST00000056924 5485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Cited2O35740 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Cited2O35740 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Cited2O35740 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Cited2O35740 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Cited2O35740 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Cited2O35740 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Cited2O35740 Fads6-201ENSMUST00000056153 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Cited2O35740 Tbc1d17-201ENSMUST00000047085 8750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Cited2O35740 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Cited2O35740 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Cited2O35740 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Cited2O35740 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Cited2O35740 Sec23a-201ENSMUST00000021375 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cited2O35740 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Cited2O35740 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cited2O35740 Amigo3-201ENSMUST00000085060 2543 ntAPPRIS P1 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cited2O35740 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cited2O35740 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cited2O35740 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cited2O35740 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cited2O35740 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Cited2O35740 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cited2O35740 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cited2O35740 Tmem92-201ENSMUST00000100554 2043 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cited2O35740 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cited2O35740 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cited2O35740 C1rb-201ENSMUST00000184647 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cited2O35740 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cited2O35740 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cited2O35740 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cited2O35740 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cited2O35740 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cited2O35740 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cited2O35740 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cited2O35740 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cited2O35740 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cited2O35740 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cited2O35740 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Cited2O35740 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cited2O35740 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cited2O35740 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cited2O35740 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cited2O35740 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Cited2O35740 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Cited2O35740 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cited2O35740 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cited2O35740 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cited2O35740 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cited2O35740 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cited2O35740 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cited2O35740 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cited2O35740 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cited2O35740 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cited2O35740 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cited2O35740 Gm38187-201ENSMUST00000195609 4709 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.7 ms