Protein–RNA interactions for Protein: A7VMS3

H2-M5, Histocompatibility 2, M region locus 5, mousemouse

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Length 348 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M5A7VMS3 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
H2-M5A7VMS3 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
H2-M5A7VMS3 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
H2-M5A7VMS3 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
H2-M5A7VMS3 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
H2-M5A7VMS3 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
H2-M5A7VMS3 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
H2-M5A7VMS3 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
H2-M5A7VMS3 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
H2-M5A7VMS3 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
H2-M5A7VMS3 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
H2-M5A7VMS3 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
H2-M5A7VMS3 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
H2-M5A7VMS3 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
H2-M5A7VMS3 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
H2-M5A7VMS3 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
H2-M5A7VMS3 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
H2-M5A7VMS3 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
H2-M5A7VMS3 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
H2-M5A7VMS3 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
H2-M5A7VMS3 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
H2-M5A7VMS3 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
H2-M5A7VMS3 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
H2-M5A7VMS3 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
H2-M5A7VMS3 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
H2-M5A7VMS3 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
H2-M5A7VMS3 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
H2-M5A7VMS3 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
H2-M5A7VMS3 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
H2-M5A7VMS3 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
H2-M5A7VMS3 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
H2-M5A7VMS3 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
H2-M5A7VMS3 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
H2-M5A7VMS3 Aldh3a1-202ENSMUST00000108716 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
H2-M5A7VMS3 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
H2-M5A7VMS3 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
H2-M5A7VMS3 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
H2-M5A7VMS3 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
H2-M5A7VMS3 Gm8110-202ENSMUST00000211297 1782 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
H2-M5A7VMS3 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.72
H2-M5A7VMS3 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
H2-M5A7VMS3 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
H2-M5A7VMS3 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
H2-M5A7VMS3 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
H2-M5A7VMS3 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
H2-M5A7VMS3 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
H2-M5A7VMS3 Nono-201ENSMUST00000033673 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
H2-M5A7VMS3 Gm36987-201ENSMUST00000194704 2979 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
H2-M5A7VMS3 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
H2-M5A7VMS3 Gm43636-201ENSMUST00000201501 2235 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
H2-M5A7VMS3 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
H2-M5A7VMS3 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
H2-M5A7VMS3 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
H2-M5A7VMS3 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
H2-M5A7VMS3 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
H2-M5A7VMS3 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
H2-M5A7VMS3 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
H2-M5A7VMS3 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
H2-M5A7VMS3 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
H2-M5A7VMS3 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
H2-M5A7VMS3 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
H2-M5A7VMS3 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
H2-M5A7VMS3 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
H2-M5A7VMS3 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.73
H2-M5A7VMS3 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
H2-M5A7VMS3 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
H2-M5A7VMS3 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
H2-M5A7VMS3 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
H2-M5A7VMS3 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
H2-M5A7VMS3 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
H2-M5A7VMS3 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
H2-M5A7VMS3 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
H2-M5A7VMS3 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
H2-M5A7VMS3 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
H2-M5A7VMS3 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
H2-M5A7VMS3 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
H2-M5A7VMS3 Esrp1-204ENSMUST00000108313 3696 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
H2-M5A7VMS3 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
H2-M5A7VMS3 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
H2-M5A7VMS3 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
H2-M5A7VMS3 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
H2-M5A7VMS3 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
H2-M5A7VMS3 Thrap3-201ENSMUST00000080919 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
H2-M5A7VMS3 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
H2-M5A7VMS3 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
H2-M5A7VMS3 Radil-203ENSMUST00000110784 3106 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
H2-M5A7VMS3 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
H2-M5A7VMS3 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
H2-M5A7VMS3 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
H2-M5A7VMS3 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
H2-M5A7VMS3 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
H2-M5A7VMS3 Gm44086-201ENSMUST00000203251 2349 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
H2-M5A7VMS3 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
H2-M5A7VMS3 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
H2-M5A7VMS3 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
H2-M5A7VMS3 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
H2-M5A7VMS3 Gm43064-201ENSMUST00000199710 3144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
H2-M5A7VMS3 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
H2-M5A7VMS3 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
H2-M5A7VMS3 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
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