Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2H7

Gipc2, PDZ domain-containing protein GIPC2, mousemouse

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Length 314 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gipc2Q9Z2H7 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gipc2Q9Z2H7 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gipc2Q9Z2H7 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gipc2Q9Z2H7 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gipc2Q9Z2H7 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gipc2Q9Z2H7 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gipc2Q9Z2H7 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Gipc2Q9Z2H7 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gipc2Q9Z2H7 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gipc2Q9Z2H7 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gipc2Q9Z2H7 Gm26787-201ENSMUST00000180474 608 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gipc2Q9Z2H7 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gipc2Q9Z2H7 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Gipc2Q9Z2H7 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gipc2Q9Z2H7 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Gipc2Q9Z2H7 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gipc2Q9Z2H7 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Gipc2Q9Z2H7 Stab1-201ENSMUST00000036618 7999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gipc2Q9Z2H7 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gipc2Q9Z2H7 Dab2ip-207ENSMUST00000112992 6184 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gipc2Q9Z2H7 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gipc2Q9Z2H7 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gipc2Q9Z2H7 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gipc2Q9Z2H7 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gipc2Q9Z2H7 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gipc2Q9Z2H7 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gipc2Q9Z2H7 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gipc2Q9Z2H7 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gipc2Q9Z2H7 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gipc2Q9Z2H7 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC12.27□□□□□ -0.44
Gipc2Q9Z2H7 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Gipc2Q9Z2H7 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Gipc2Q9Z2H7 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Gipc2Q9Z2H7 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Gipc2Q9Z2H7 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Gipc2Q9Z2H7 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Gipc2Q9Z2H7 Strc-201ENSMUST00000038389 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
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Gipc2Q9Z2H7 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Gipc2Q9Z2H7 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Gipc2Q9Z2H7 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Gipc2Q9Z2H7 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Gipc2Q9Z2H7 Prdx6b-201ENSMUST00000057072 2885 ntAPPRIS P1 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gipc2Q9Z2H7 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
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Gipc2Q9Z2H7 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC12.27□□□□□ -0.45
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Gipc2Q9Z2H7 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
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Gipc2Q9Z2H7 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
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Gipc2Q9Z2H7 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Gipc2Q9Z2H7 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
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Gipc2Q9Z2H7 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
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Gipc2Q9Z2H7 Abcc10-201ENSMUST00000047970 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gipc2Q9Z2H7 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gipc2Q9Z2H7 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gipc2Q9Z2H7 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Gipc2Q9Z2H7 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gipc2Q9Z2H7 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Gipc2Q9Z2H7 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gipc2Q9Z2H7 Prdm1-201ENSMUST00000039174 5281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gipc2Q9Z2H7 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gipc2Q9Z2H7 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gipc2Q9Z2H7 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gipc2Q9Z2H7 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gipc2Q9Z2H7 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gipc2Q9Z2H7 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gipc2Q9Z2H7 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gipc2Q9Z2H7 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gipc2Q9Z2H7 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gipc2Q9Z2H7 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gipc2Q9Z2H7 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gipc2Q9Z2H7 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gipc2Q9Z2H7 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Gipc2Q9Z2H7 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gipc2Q9Z2H7 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Gipc2Q9Z2H7 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms