Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER65

Clstn2, Calsyntenin-2, mousemouse

Predictions only

Length 966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn2Q9ER65 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Clstn2Q9ER65 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Clstn2Q9ER65 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Clstn2Q9ER65 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Clstn2Q9ER65 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Clstn2Q9ER65 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Clstn2Q9ER65 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Clstn2Q9ER65 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Clstn2Q9ER65 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Clstn2Q9ER65 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Clstn2Q9ER65 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Clstn2Q9ER65 6230400D17Rik-201ENSMUST00000180987 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Clstn2Q9ER65 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Clstn2Q9ER65 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Clstn2Q9ER65 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Clstn2Q9ER65 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Clstn2Q9ER65 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Clstn2Q9ER65 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Clstn2Q9ER65 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Clstn2Q9ER65 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Clstn2Q9ER65 Ttc4-202ENSMUST00000106772 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Clstn2Q9ER65 Gm15610-201ENSMUST00000120584 195 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Clstn2Q9ER65 C730034F03Rik-201ENSMUST00000168646 1280 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Clstn2Q9ER65 Gm8815-201ENSMUST00000173809 620 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Clstn2Q9ER65 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Clstn2Q9ER65 Gm19705-203ENSMUST00000181491 678 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Clstn2Q9ER65 Gm10550-201ENSMUST00000188846 982 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Clstn2Q9ER65 Qdpr-209ENSMUST00000198258 1172 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Clstn2Q9ER65 Gm44126-201ENSMUST00000204831 514 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Clstn2Q9ER65 Gm45550-201ENSMUST00000209380 946 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Clstn2Q9ER65 AC159103.1-201ENSMUST00000228325 429 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Clstn2Q9ER65 Tas2r126-201ENSMUST00000059534 930 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Clstn2Q9ER65 Rsg1-201ENSMUST00000097813 985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Clstn2Q9ER65 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Clstn2Q9ER65 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Clstn2Q9ER65 Tubb4b-ps2-201ENSMUST00000187481 1337 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Clstn2Q9ER65 Tnk2os-201ENSMUST00000141256 1392 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Clstn2Q9ER65 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Clstn2Q9ER65 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Clstn2Q9ER65 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Clstn2Q9ER65 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Clstn2Q9ER65 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Clstn2Q9ER65 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Clstn2Q9ER65 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Clstn2Q9ER65 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Clstn2Q9ER65 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Clstn2Q9ER65 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Clstn2Q9ER65 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Clstn2Q9ER65 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Clstn2Q9ER65 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Clstn2Q9ER65 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Clstn2Q9ER65 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Clstn2Q9ER65 Gm5795-201ENSMUST00000100920 984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Clstn2Q9ER65 Gngt2-205ENSMUST00000107711 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Clstn2Q9ER65 Rdh9-203ENSMUST00000136223 1276 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Clstn2Q9ER65 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Clstn2Q9ER65 Gm3685-201ENSMUST00000169215 984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Clstn2Q9ER65 Hspb9-202ENSMUST00000169833 726 ntAPPRIS P2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Clstn2Q9ER65 Ctdspl-202ENSMUST00000172464 798 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Clstn2Q9ER65 Mir7032-201ENSMUST00000185154 79 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Clstn2Q9ER65 Stpg4-202ENSMUST00000186211 591 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Clstn2Q9ER65 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Clstn2Q9ER65 Fam168a-204ENSMUST00000207564 1083 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Clstn2Q9ER65 Gm44545-201ENSMUST00000208262 746 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Clstn2Q9ER65 Lgals4-207ENSMUST00000208971 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Clstn2Q9ER65 Gm2553-201ENSMUST00000215986 605 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Clstn2Q9ER65 Rps12-208ENSMUST00000220070 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Clstn2Q9ER65 Ngdn-201ENSMUST00000022815 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Clstn2Q9ER65 Fam151b-201ENSMUST00000040106 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Clstn2Q9ER65 Gm9785-201ENSMUST00000062642 1006 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Clstn2Q9ER65 Gm10338-201ENSMUST00000096148 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Clstn2Q9ER65 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Clstn2Q9ER65 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Clstn2Q9ER65 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Clstn2Q9ER65 Pcgf2-202ENSMUST00000103148 1438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Clstn2Q9ER65 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Clstn2Q9ER65 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Clstn2Q9ER65 Cyp4x1-201ENSMUST00000051400 1524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Clstn2Q9ER65 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Clstn2Q9ER65 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Clstn2Q9ER65 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Clstn2Q9ER65 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Clstn2Q9ER65 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Clstn2Q9ER65 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Clstn2Q9ER65 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Clstn2Q9ER65 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Clstn2Q9ER65 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Clstn2Q9ER65 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Clstn2Q9ER65 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Clstn2Q9ER65 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Clstn2Q9ER65 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Clstn2Q9ER65 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Clstn2Q9ER65 Gm826-202ENSMUST00000109475 803 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Clstn2Q9ER65 Cav2-202ENSMUST00000115459 974 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Clstn2Q9ER65 Gm12029-201ENSMUST00000120073 832 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Clstn2Q9ER65 Mup-ps26-201ENSMUST00000121751 202 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Clstn2Q9ER65 Gm14665-201ENSMUST00000122294 557 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Clstn2Q9ER65 Gm3948-201ENSMUST00000147795 421 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Clstn2Q9ER65 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Clstn2Q9ER65 Tspo2-205ENSMUST00000162481 473 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.7 ms