Protein–RNA interactions for Protein: Q99NF2

Nsmf, NMDA receptor synaptonuclear signaling and neuronal migration factor, mousemouse

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Length 532 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NsmfQ99NF2 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NsmfQ99NF2 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NsmfQ99NF2 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NsmfQ99NF2 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NsmfQ99NF2 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NsmfQ99NF2 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NsmfQ99NF2 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NsmfQ99NF2 Ccl27a-203ENSMUST00000108033 428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NsmfQ99NF2 Gm13611-201ENSMUST00000118269 318 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
NsmfQ99NF2 Gm11450-201ENSMUST00000121144 333 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
NsmfQ99NF2 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NsmfQ99NF2 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NsmfQ99NF2 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
NsmfQ99NF2 Gm22334-201ENSMUST00000158070 133 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
NsmfQ99NF2 Gm7568-202ENSMUST00000160446 709 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NsmfQ99NF2 Gm38304-201ENSMUST00000161826 600 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NsmfQ99NF2 5330413P13Rik-205ENSMUST00000210961 913 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NsmfQ99NF2 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NsmfQ99NF2 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NsmfQ99NF2 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NsmfQ99NF2 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NsmfQ99NF2 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NsmfQ99NF2 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NsmfQ99NF2 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NsmfQ99NF2 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NsmfQ99NF2 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NsmfQ99NF2 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NsmfQ99NF2 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NsmfQ99NF2 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NsmfQ99NF2 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NsmfQ99NF2 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NsmfQ99NF2 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NsmfQ99NF2 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NsmfQ99NF2 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NsmfQ99NF2 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NsmfQ99NF2 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NsmfQ99NF2 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NsmfQ99NF2 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NsmfQ99NF2 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NsmfQ99NF2 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NsmfQ99NF2 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NsmfQ99NF2 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NsmfQ99NF2 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NsmfQ99NF2 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NsmfQ99NF2 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NsmfQ99NF2 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NsmfQ99NF2 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NsmfQ99NF2 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NsmfQ99NF2 Tm2d3-203ENSMUST00000107495 1003 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NsmfQ99NF2 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NsmfQ99NF2 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
NsmfQ99NF2 n-R5s14-201ENSMUST00000122688 107 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
NsmfQ99NF2 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NsmfQ99NF2 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NsmfQ99NF2 Gm18038-201ENSMUST00000197900 485 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
NsmfQ99NF2 Gm34728-201ENSMUST00000201510 414 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NsmfQ99NF2 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NsmfQ99NF2 Gm44710-201ENSMUST00000208885 471 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NsmfQ99NF2 Gm45765-201ENSMUST00000212027 1035 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NsmfQ99NF2 Tnfrsf19-203ENSMUST00000224371 1239 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NsmfQ99NF2 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NsmfQ99NF2 Sftpd-201ENSMUST00000077136 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NsmfQ99NF2 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NsmfQ99NF2 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NsmfQ99NF2 Spata48-201ENSMUST00000020410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NsmfQ99NF2 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NsmfQ99NF2 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
NsmfQ99NF2 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NsmfQ99NF2 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NsmfQ99NF2 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NsmfQ99NF2 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NsmfQ99NF2 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NsmfQ99NF2 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NsmfQ99NF2 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NsmfQ99NF2 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NsmfQ99NF2 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NsmfQ99NF2 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NsmfQ99NF2 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NsmfQ99NF2 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NsmfQ99NF2 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NsmfQ99NF2 Lyzl6-202ENSMUST00000107014 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NsmfQ99NF2 Got2-ps1-201ENSMUST00000121655 1293 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
NsmfQ99NF2 Ankrd29-202ENSMUST00000122408 850 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NsmfQ99NF2 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NsmfQ99NF2 Bcas3os2-201ENSMUST00000134305 661 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NsmfQ99NF2 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NsmfQ99NF2 Smim5-203ENSMUST00000152171 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NsmfQ99NF2 Tmem116-209ENSMUST00000156080 1184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NsmfQ99NF2 Lmo3-202ENSMUST00000161450 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NsmfQ99NF2 Arid3b-204ENSMUST00000164010 1259 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NsmfQ99NF2 Rps13-ps2-201ENSMUST00000182017 453 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
NsmfQ99NF2 Gm5369-201ENSMUST00000217499 588 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
NsmfQ99NF2 AC131330.1-201ENSMUST00000227814 1015 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
NsmfQ99NF2 Il17c-201ENSMUST00000050963 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NsmfQ99NF2 Wfdc21-201ENSMUST00000070832 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NsmfQ99NF2 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NsmfQ99NF2 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NsmfQ99NF2 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NsmfQ99NF2 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NsmfQ99NF2 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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