Protein–RNA interactions for Protein: Q8K5B8

Hoxc12, Homeobox protein Hox-C12, mousemouse

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Length 280 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc12Q8K5B8 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Hoxc12Q8K5B8 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Hoxc12Q8K5B8 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Hoxc12Q8K5B8 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Hoxc12Q8K5B8 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Hoxc12Q8K5B8 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Hoxc12Q8K5B8 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Hoxc12Q8K5B8 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Hoxc12Q8K5B8 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Hoxc12Q8K5B8 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Hoxc12Q8K5B8 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Hoxc12Q8K5B8 Gm22042-201ENSMUST00000082989 165 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Hoxc12Q8K5B8 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Hoxc12Q8K5B8 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Hoxc12Q8K5B8 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Hoxc12Q8K5B8 Gm26110-201ENSMUST00000083971 165 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Hoxc12Q8K5B8 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Hoxc12Q8K5B8 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Hoxc12Q8K5B8 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Hoxc12Q8K5B8 Camk1d-201ENSMUST00000044009 6962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Hoxc12Q8K5B8 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Hoxc12Q8K5B8 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Hoxc12Q8K5B8 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Hoxc12Q8K5B8 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Hoxc12Q8K5B8 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Hoxc12Q8K5B8 Scaf4-202ENSMUST00000163419 4169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Hoxc12Q8K5B8 4833418N02Rik-201ENSMUST00000137539 1820 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Hoxc12Q8K5B8 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Hoxc12Q8K5B8 Plekha6-204ENSMUST00000187285 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Hoxc12Q8K5B8 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Hoxc12Q8K5B8 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Hoxc12Q8K5B8 Ctnnd1-204ENSMUST00000099941 5783 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Hoxc12Q8K5B8 Cacna1c-205ENSMUST00000112825 7577 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Hoxc12Q8K5B8 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Hoxc12Q8K5B8 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Hoxc12Q8K5B8 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Hoxc12Q8K5B8 Zmiz1-208ENSMUST00000162645 7482 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Hoxc12Q8K5B8 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Hoxc12Q8K5B8 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Hoxc12Q8K5B8 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Hoxc12Q8K5B8 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Hoxc12Q8K5B8 Madd-207ENSMUST00000111369 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Hoxc12Q8K5B8 Trpv3-201ENSMUST00000049676 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Hoxc12Q8K5B8 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Hoxc12Q8K5B8 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Hoxc12Q8K5B8 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Hoxc12Q8K5B8 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Hoxc12Q8K5B8 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Hoxc12Q8K5B8 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Hoxc12Q8K5B8 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Hoxc12Q8K5B8 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Hoxc12Q8K5B8 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Hoxc12Q8K5B8 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Hoxc12Q8K5B8 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Hoxc12Q8K5B8 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Hoxc12Q8K5B8 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Hoxc12Q8K5B8 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Hoxc12Q8K5B8 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Hoxc12Q8K5B8 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Hoxc12Q8K5B8 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Hoxc12Q8K5B8 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Hoxc12Q8K5B8 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Hoxc12Q8K5B8 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
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Hoxc12Q8K5B8 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
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Hoxc12Q8K5B8 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Hoxc12Q8K5B8 AC159747.1-201ENSMUST00000219903 265 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Hoxc12Q8K5B8 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Hoxc12Q8K5B8 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Hoxc12Q8K5B8 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Hoxc12Q8K5B8 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Hoxc12Q8K5B8 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Hoxc12Q8K5B8 Fut2-201ENSMUST00000069800 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Hoxc12Q8K5B8 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Hoxc12Q8K5B8 Rapgef3-205ENSMUST00000129223 3750 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Hoxc12Q8K5B8 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Hoxc12Q8K5B8 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Hoxc12Q8K5B8 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Hoxc12Q8K5B8 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Hoxc12Q8K5B8 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Hoxc12Q8K5B8 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Hoxc12Q8K5B8 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Hoxc12Q8K5B8 Gm21136-201ENSMUST00000186812 2575 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Hoxc12Q8K5B8 Hr-205ENSMUST00000163060 5278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Hoxc12Q8K5B8 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Hoxc12Q8K5B8 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Hoxc12Q8K5B8 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Hoxc12Q8K5B8 Zmynd8-203ENSMUST00000099084 5232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Hoxc12Q8K5B8 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Hoxc12Q8K5B8 Gm37600-201ENSMUST00000193764 3292 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Hoxc12Q8K5B8 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Hoxc12Q8K5B8 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Hoxc12Q8K5B8 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Hoxc12Q8K5B8 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Hoxc12Q8K5B8 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Hoxc12Q8K5B8 Rab11fip4os1-201ENSMUST00000145652 2187 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Hoxc12Q8K5B8 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Hoxc12Q8K5B8 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Hoxc12Q8K5B8 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
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