Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Y9

Ccm2, Cerebral cavernous malformations protein 2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 453 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccm2Q8K2Y9 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccm2Q8K2Y9 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccm2Q8K2Y9 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccm2Q8K2Y9 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccm2Q8K2Y9 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccm2Q8K2Y9 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccm2Q8K2Y9 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccm2Q8K2Y9 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccm2Q8K2Y9 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccm2Q8K2Y9 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccm2Q8K2Y9 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccm2Q8K2Y9 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccm2Q8K2Y9 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccm2Q8K2Y9 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccm2Q8K2Y9 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccm2Q8K2Y9 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccm2Q8K2Y9 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccm2Q8K2Y9 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccm2Q8K2Y9 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccm2Q8K2Y9 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccm2Q8K2Y9 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccm2Q8K2Y9 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccm2Q8K2Y9 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccm2Q8K2Y9 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccm2Q8K2Y9 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccm2Q8K2Y9 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccm2Q8K2Y9 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccm2Q8K2Y9 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccm2Q8K2Y9 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccm2Q8K2Y9 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccm2Q8K2Y9 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccm2Q8K2Y9 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccm2Q8K2Y9 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccm2Q8K2Y9 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccm2Q8K2Y9 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccm2Q8K2Y9 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccm2Q8K2Y9 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccm2Q8K2Y9 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccm2Q8K2Y9 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccm2Q8K2Y9 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccm2Q8K2Y9 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccm2Q8K2Y9 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccm2Q8K2Y9 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccm2Q8K2Y9 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccm2Q8K2Y9 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccm2Q8K2Y9 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccm2Q8K2Y9 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccm2Q8K2Y9 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccm2Q8K2Y9 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccm2Q8K2Y9 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccm2Q8K2Y9 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccm2Q8K2Y9 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccm2Q8K2Y9 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccm2Q8K2Y9 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccm2Q8K2Y9 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccm2Q8K2Y9 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccm2Q8K2Y9 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccm2Q8K2Y9 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccm2Q8K2Y9 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccm2Q8K2Y9 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccm2Q8K2Y9 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccm2Q8K2Y9 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccm2Q8K2Y9 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccm2Q8K2Y9 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccm2Q8K2Y9 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccm2Q8K2Y9 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccm2Q8K2Y9 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccm2Q8K2Y9 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccm2Q8K2Y9 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccm2Q8K2Y9 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccm2Q8K2Y9 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccm2Q8K2Y9 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccm2Q8K2Y9 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccm2Q8K2Y9 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccm2Q8K2Y9 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccm2Q8K2Y9 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccm2Q8K2Y9 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccm2Q8K2Y9 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccm2Q8K2Y9 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccm2Q8K2Y9 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccm2Q8K2Y9 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccm2Q8K2Y9 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccm2Q8K2Y9 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccm2Q8K2Y9 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccm2Q8K2Y9 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccm2Q8K2Y9 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccm2Q8K2Y9 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccm2Q8K2Y9 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccm2Q8K2Y9 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccm2Q8K2Y9 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccm2Q8K2Y9 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccm2Q8K2Y9 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccm2Q8K2Y9 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccm2Q8K2Y9 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccm2Q8K2Y9 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccm2Q8K2Y9 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccm2Q8K2Y9 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccm2Q8K2Y9 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccm2Q8K2Y9 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccm2Q8K2Y9 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.1 ms