Protein–RNA interactions for Protein: Q8C2S7

Amigo3, Amphoterin-induced protein 3, mousemouse

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Length 508 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Amigo3Q8C2S7 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Amigo3Q8C2S7 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Amigo3Q8C2S7 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Amigo3Q8C2S7 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Amigo3Q8C2S7 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Amigo3Q8C2S7 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Amigo3Q8C2S7 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Amigo3Q8C2S7 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Amigo3Q8C2S7 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Amigo3Q8C2S7 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Amigo3Q8C2S7 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Amigo3Q8C2S7 Eno1-201ENSMUST00000080149 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Amigo3Q8C2S7 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Amigo3Q8C2S7 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Amigo3Q8C2S7 Ifna9-201ENSMUST00000102807 573 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
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Amigo3Q8C2S7 Apoc3-202ENSMUST00000118649 453 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
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Amigo3Q8C2S7 Gm42953-201ENSMUST00000199363 581 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Amigo3Q8C2S7 Gm7939-201ENSMUST00000201233 1050 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Amigo3Q8C2S7 BC080696-201ENSMUST00000202858 1218 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
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Amigo3Q8C2S7 Gm46224-201ENSMUST00000220221 1242 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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Amigo3Q8C2S7 Try5-201ENSMUST00000064324 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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Amigo3Q8C2S7 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Amigo3Q8C2S7 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Amigo3Q8C2S7 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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Amigo3Q8C2S7 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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Amigo3Q8C2S7 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Amigo3Q8C2S7 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Amigo3Q8C2S7 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Amigo3Q8C2S7 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Amigo3Q8C2S7 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Amigo3Q8C2S7 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Amigo3Q8C2S7 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Amigo3Q8C2S7 Lexm-202ENSMUST00000106788 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Amigo3Q8C2S7 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Amigo3Q8C2S7 5430405H02Rik-201ENSMUST00000153616 1431 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Amigo3Q8C2S7 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Amigo3Q8C2S7 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Amigo3Q8C2S7 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Amigo3Q8C2S7 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Amigo3Q8C2S7 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms