Protein–RNA interactions for Protein: Q8C156

Ncaph, Condensin complex subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 731 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NcaphQ8C156 Cmtm2b-201ENSMUST00000041973 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NcaphQ8C156 Cthrc1-201ENSMUST00000067072 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NcaphQ8C156 Gm10179-201ENSMUST00000086233 688 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
NcaphQ8C156 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NcaphQ8C156 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NcaphQ8C156 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NcaphQ8C156 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NcaphQ8C156 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NcaphQ8C156 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NcaphQ8C156 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NcaphQ8C156 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NcaphQ8C156 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NcaphQ8C156 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NcaphQ8C156 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NcaphQ8C156 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NcaphQ8C156 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NcaphQ8C156 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NcaphQ8C156 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
NcaphQ8C156 Gm13812-201ENSMUST00000118061 1347 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
NcaphQ8C156 Gm13810-201ENSMUST00000118584 1347 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
NcaphQ8C156 Tectb-202ENSMUST00000120936 1349 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
NcaphQ8C156 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NcaphQ8C156 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NcaphQ8C156 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
NcaphQ8C156 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
NcaphQ8C156 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NcaphQ8C156 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NcaphQ8C156 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NcaphQ8C156 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NcaphQ8C156 AC163354.1-205ENSMUST00000223262 1511 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
NcaphQ8C156 B430119L08Rik-201ENSMUST00000130054 1994 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NcaphQ8C156 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NcaphQ8C156 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NcaphQ8C156 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NcaphQ8C156 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NcaphQ8C156 Krtap4-8-201ENSMUST00000107439 983 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
NcaphQ8C156 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
NcaphQ8C156 Anp32a-205ENSMUST00000135395 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
NcaphQ8C156 Gm53-203ENSMUST00000143887 757 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
NcaphQ8C156 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NcaphQ8C156 Gm3332-201ENSMUST00000189337 928 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
NcaphQ8C156 Gm5733-201ENSMUST00000190232 939 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
NcaphQ8C156 Washc3-201ENSMUST00000020248 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NcaphQ8C156 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
NcaphQ8C156 Gm44545-201ENSMUST00000208262 746 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
NcaphQ8C156 AC101677.2-201ENSMUST00000218733 741 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
NcaphQ8C156 Zfp36l1-203ENSMUST00000218835 292 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
NcaphQ8C156 Csrp2-203ENSMUST00000219502 544 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
NcaphQ8C156 AC135469.1-201ENSMUST00000225984 772 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
NcaphQ8C156 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NcaphQ8C156 Cd7-201ENSMUST00000026159 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NcaphQ8C156 Olfr462-201ENSMUST00000049743 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
NcaphQ8C156 Cd320-202ENSMUST00000087559 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NcaphQ8C156 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NcaphQ8C156 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NcaphQ8C156 Odf2-208ENSMUST00000113763 2364 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
NcaphQ8C156 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NcaphQ8C156 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NcaphQ8C156 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NcaphQ8C156 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NcaphQ8C156 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NcaphQ8C156 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NcaphQ8C156 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NcaphQ8C156 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
NcaphQ8C156 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NcaphQ8C156 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NcaphQ8C156 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NcaphQ8C156 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NcaphQ8C156 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
NcaphQ8C156 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NcaphQ8C156 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NcaphQ8C156 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NcaphQ8C156 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
NcaphQ8C156 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NcaphQ8C156 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
NcaphQ8C156 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NcaphQ8C156 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NcaphQ8C156 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NcaphQ8C156 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NcaphQ8C156 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
NcaphQ8C156 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
NcaphQ8C156 Fam129a-203ENSMUST00000111875 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NcaphQ8C156 Olfr1347-205ENSMUST00000220413 964 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
NcaphQ8C156 CT009713.8-201ENSMUST00000225448 560 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
NcaphQ8C156 Olfr1347-201ENSMUST00000036357 964 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
NcaphQ8C156 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
NcaphQ8C156 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
NcaphQ8C156 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NcaphQ8C156 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NcaphQ8C156 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NcaphQ8C156 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
NcaphQ8C156 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NcaphQ8C156 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NcaphQ8C156 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NcaphQ8C156 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NcaphQ8C156 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NcaphQ8C156 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NcaphQ8C156 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NcaphQ8C156 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
NcaphQ8C156 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms