Protein–RNA interactions for Protein: Q8BW72

Kdm4a, Lysine-specific demethylase 4A, mousemouse

Predictions only

Length 1,064 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm4aQ8BW72 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Kdm4aQ8BW72 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Kdm4aQ8BW72 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Kdm4aQ8BW72 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Kdm4aQ8BW72 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Kdm4aQ8BW72 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Kdm4aQ8BW72 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Kdm4aQ8BW72 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Kdm4aQ8BW72 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Kdm4aQ8BW72 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Kdm4aQ8BW72 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Kdm4aQ8BW72 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Kdm4aQ8BW72 Syt7-202ENSMUST00000076968 6624 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Kdm4aQ8BW72 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Kdm4aQ8BW72 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Kdm4aQ8BW72 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Kdm4aQ8BW72 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Kdm4aQ8BW72 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Kdm4aQ8BW72 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Kdm4aQ8BW72 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Kdm4aQ8BW72 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Kdm4aQ8BW72 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Kdm4aQ8BW72 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Kdm4aQ8BW72 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Kdm4aQ8BW72 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Kdm4aQ8BW72 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Kdm4aQ8BW72 Wapl-202ENSMUST00000090027 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Kdm4aQ8BW72 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Kdm4aQ8BW72 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Kdm4aQ8BW72 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Kdm4aQ8BW72 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Kdm4aQ8BW72 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Kdm4aQ8BW72 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Kdm4aQ8BW72 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Kdm4aQ8BW72 Mgmt-201ENSMUST00000081510 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Kdm4aQ8BW72 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Kdm4aQ8BW72 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Kdm4aQ8BW72 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Kdm4aQ8BW72 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Kdm4aQ8BW72 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Kdm4aQ8BW72 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Kdm4aQ8BW72 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Kdm4aQ8BW72 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Kdm4aQ8BW72 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Kdm4aQ8BW72 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Kdm4aQ8BW72 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Kdm4aQ8BW72 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Kdm4aQ8BW72 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Kdm4aQ8BW72 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Kdm4aQ8BW72 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Kdm4aQ8BW72 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Kdm4aQ8BW72 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Kdm4aQ8BW72 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Kdm4aQ8BW72 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Kdm4aQ8BW72 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Kdm4aQ8BW72 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Kdm4aQ8BW72 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Kdm4aQ8BW72 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Kdm4aQ8BW72 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Kdm4aQ8BW72 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Kdm4aQ8BW72 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Kdm4aQ8BW72 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Kdm4aQ8BW72 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Kdm4aQ8BW72 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Kdm4aQ8BW72 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Kdm4aQ8BW72 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Kdm4aQ8BW72 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Kdm4aQ8BW72 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Kdm4aQ8BW72 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Kdm4aQ8BW72 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Kdm4aQ8BW72 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Kdm4aQ8BW72 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Kdm4aQ8BW72 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Kdm4aQ8BW72 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Kdm4aQ8BW72 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Kdm4aQ8BW72 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Kdm4aQ8BW72 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Kdm4aQ8BW72 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Kdm4aQ8BW72 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Kdm4aQ8BW72 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Kdm4aQ8BW72 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Kdm4aQ8BW72 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Kdm4aQ8BW72 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Kdm4aQ8BW72 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Kdm4aQ8BW72 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Kdm4aQ8BW72 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Kdm4aQ8BW72 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Kdm4aQ8BW72 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Kdm4aQ8BW72 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Kdm4aQ8BW72 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Kdm4aQ8BW72 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Kdm4aQ8BW72 Eif5-213ENSMUST00000222388 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Kdm4aQ8BW72 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Kdm4aQ8BW72 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Kdm4aQ8BW72 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Kdm4aQ8BW72 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Kdm4aQ8BW72 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Kdm4aQ8BW72 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Kdm4aQ8BW72 AC154639.1-201ENSMUST00000224393 2849 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Kdm4aQ8BW72 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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