Protein–RNA interactions for Protein: Q8BW70

Usp38, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 38, mousemouse

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Length 1,042 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp38Q8BW70 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp38Q8BW70 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp38Q8BW70 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp38Q8BW70 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp38Q8BW70 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp38Q8BW70 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
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Usp38Q8BW70 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
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Usp38Q8BW70 Gm13408-201ENSMUST00000119822 798 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp38Q8BW70 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp38Q8BW70 Gm13935-201ENSMUST00000121859 798 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp38Q8BW70 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp38Q8BW70 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp38Q8BW70 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp38Q8BW70 Gm5778-201ENSMUST00000171003 1072 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp38Q8BW70 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp38Q8BW70 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp38Q8BW70 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp38Q8BW70 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp38Q8BW70 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
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Usp38Q8BW70 Fabp6-201ENSMUST00000020672 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp38Q8BW70 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp38Q8BW70 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp38Q8BW70 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp38Q8BW70 AC135469.1-201ENSMUST00000225984 772 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp38Q8BW70 Pf4-201ENSMUST00000031320 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp38Q8BW70 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp38Q8BW70 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp38Q8BW70 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp38Q8BW70 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp38Q8BW70 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp38Q8BW70 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp38Q8BW70 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp38Q8BW70 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp38Q8BW70 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp38Q8BW70 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp38Q8BW70 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
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Usp38Q8BW70 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Usp38Q8BW70 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Usp38Q8BW70 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
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Usp38Q8BW70 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Usp38Q8BW70 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Usp38Q8BW70 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
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Usp38Q8BW70 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Usp38Q8BW70 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
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Usp38Q8BW70 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
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Usp38Q8BW70 Tmem190-201ENSMUST00000013235 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
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Usp38Q8BW70 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Usp38Q8BW70 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Usp38Q8BW70 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Usp38Q8BW70 Fcna-201ENSMUST00000028307 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Usp38Q8BW70 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Usp38Q8BW70 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Usp38Q8BW70 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Usp38Q8BW70 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Usp38Q8BW70 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Usp38Q8BW70 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Usp38Q8BW70 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Usp38Q8BW70 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Usp38Q8BW70 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp38Q8BW70 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp38Q8BW70 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp38Q8BW70 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp38Q8BW70 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp38Q8BW70 Rnf133-201ENSMUST00000063548 1308 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp38Q8BW70 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp38Q8BW70 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp38Q8BW70 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp38Q8BW70 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp38Q8BW70 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp38Q8BW70 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
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