Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJQ2

Usp1, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 1, mousemouse

Predictions only

Length 784 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp1Q8BJQ2 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp1Q8BJQ2 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp1Q8BJQ2 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp1Q8BJQ2 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp1Q8BJQ2 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp1Q8BJQ2 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp1Q8BJQ2 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp1Q8BJQ2 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp1Q8BJQ2 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp1Q8BJQ2 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp1Q8BJQ2 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp1Q8BJQ2 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp1Q8BJQ2 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp1Q8BJQ2 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp1Q8BJQ2 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp1Q8BJQ2 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp1Q8BJQ2 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp1Q8BJQ2 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp1Q8BJQ2 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp1Q8BJQ2 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp1Q8BJQ2 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp1Q8BJQ2 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp1Q8BJQ2 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp1Q8BJQ2 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp1Q8BJQ2 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp1Q8BJQ2 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp1Q8BJQ2 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp1Q8BJQ2 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp1Q8BJQ2 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp1Q8BJQ2 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp1Q8BJQ2 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp1Q8BJQ2 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp1Q8BJQ2 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp1Q8BJQ2 Apoe-208ENSMUST00000174191 472 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp1Q8BJQ2 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp1Q8BJQ2 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp1Q8BJQ2 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp1Q8BJQ2 Net1-206ENSMUST00000222504 447 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp1Q8BJQ2 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp1Q8BJQ2 Rpl10a-201ENSMUST00000042334 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp1Q8BJQ2 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp1Q8BJQ2 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp1Q8BJQ2 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp1Q8BJQ2 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp1Q8BJQ2 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp1Q8BJQ2 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp1Q8BJQ2 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp1Q8BJQ2 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp1Q8BJQ2 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp1Q8BJQ2 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp1Q8BJQ2 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp1Q8BJQ2 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp1Q8BJQ2 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Usp1Q8BJQ2 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp1Q8BJQ2 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp1Q8BJQ2 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Usp1Q8BJQ2 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Usp1Q8BJQ2 Gm43701-201ENSMUST00000202047 391 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp1Q8BJQ2 Gm44136-201ENSMUST00000203819 1106 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp1Q8BJQ2 Bnip3l-ps-202ENSMUST00000220709 1132 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp1Q8BJQ2 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp1Q8BJQ2 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp1Q8BJQ2 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp1Q8BJQ2 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp1Q8BJQ2 Ly6g5c-201ENSMUST00000037849 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp1Q8BJQ2 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp1Q8BJQ2 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp1Q8BJQ2 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp1Q8BJQ2 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp1Q8BJQ2 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp1Q8BJQ2 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp1Q8BJQ2 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp1Q8BJQ2 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp1Q8BJQ2 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp1Q8BJQ2 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp1Q8BJQ2 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp1Q8BJQ2 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp1Q8BJQ2 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp1Q8BJQ2 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp1Q8BJQ2 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Usp1Q8BJQ2 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Usp1Q8BJQ2 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Usp1Q8BJQ2 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.4 ms