Protein–RNA interactions for Protein: Q80VR2

Ell3, RNA polymerase II elongation factor ELL3, mousemouse

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Length 395 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ell3Q80VR2 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Ell3Q80VR2 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Ell3Q80VR2 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ell3Q80VR2 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ell3Q80VR2 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ell3Q80VR2 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ell3Q80VR2 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ell3Q80VR2 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ell3Q80VR2 Traf7-202ENSMUST00000088464 2504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ell3Q80VR2 Cd93-201ENSMUST00000099269 6677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ell3Q80VR2 Bmp1-201ENSMUST00000022693 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ell3Q80VR2 Gon4l-203ENSMUST00000107498 7537 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ell3Q80VR2 Kirrel3-209ENSMUST00000190549 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ell3Q80VR2 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ell3Q80VR2 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ell3Q80VR2 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ell3Q80VR2 Ifnar1-201ENSMUST00000023689 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ell3Q80VR2 Pla2g4b-201ENSMUST00000126150 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ell3Q80VR2 Plcd4-206ENSMUST00000113750 2692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ell3Q80VR2 Sash3-201ENSMUST00000033427 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ell3Q80VR2 Epha5-205ENSMUST00000113403 4675 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ell3Q80VR2 Pcdhb17-201ENSMUST00000053856 4660 ntAPPRIS P1 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ell3Q80VR2 Pcdhb14-201ENSMUST00000052387 8695 ntAPPRIS P1 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ell3Q80VR2 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ell3Q80VR2 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ell3Q80VR2 Topbp1-201ENSMUST00000035164 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ell3Q80VR2 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Ell3Q80VR2 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ell3Q80VR2 Grin2b-202ENSMUST00000111905 7484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ell3Q80VR2 Galnt10-201ENSMUST00000066987 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ell3Q80VR2 Lhx9-204ENSMUST00000112026 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ell3Q80VR2 Hvcn1-202ENSMUST00000100747 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ell3Q80VR2 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ell3Q80VR2 Prps1-201ENSMUST00000033809 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ell3Q80VR2 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ell3Q80VR2 Akap12-201ENSMUST00000045730 6195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ell3Q80VR2 Kalrn-206ENSMUST00000114954 4677 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ell3Q80VR2 Tmprss6-201ENSMUST00000017086 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ell3Q80VR2 Fam107b-201ENSMUST00000027965 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ell3Q80VR2 Tiam1-203ENSMUST00000114122 4596 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ell3Q80VR2 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ell3Q80VR2 Gm17244-201ENSMUST00000192482 3416 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Ell3Q80VR2 Dzip1l-201ENSMUST00000078367 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ell3Q80VR2 Exosc10-202ENSMUST00000076022 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ell3Q80VR2 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ell3Q80VR2 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ell3Q80VR2 Pip5k1b-201ENSMUST00000025800 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ell3Q80VR2 Olfr478-202ENSMUST00000210173 2477 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ell3Q80VR2 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ell3Q80VR2 Rdh13-201ENSMUST00000008579 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ell3Q80VR2 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ell3Q80VR2 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ell3Q80VR2 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ell3Q80VR2 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Ell3Q80VR2 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ell3Q80VR2 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Ell3Q80VR2 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ell3Q80VR2 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ell3Q80VR2 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ell3Q80VR2 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ell3Q80VR2 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Ell3Q80VR2 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ell3Q80VR2 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ell3Q80VR2 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ell3Q80VR2 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Ell3Q80VR2 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ell3Q80VR2 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ell3Q80VR2 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ell3Q80VR2 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ell3Q80VR2 Vmn1r45-206ENSMUST00000227977 3297 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ell3Q80VR2 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ell3Q80VR2 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ell3Q80VR2 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ell3Q80VR2 Zbtb21-201ENSMUST00000052089 5410 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ell3Q80VR2 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ell3Q80VR2 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ell3Q80VR2 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ell3Q80VR2 Rps6kl1-202ENSMUST00000221972 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ell3Q80VR2 Srebf1-201ENSMUST00000020846 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ell3Q80VR2 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ell3Q80VR2 Iqgap3-201ENSMUST00000071812 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ell3Q80VR2 Slc25a48-201ENSMUST00000021971 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ell3Q80VR2 Cbx7-201ENSMUST00000089293 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ell3Q80VR2 Gm6124-201ENSMUST00000188240 2580 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Ell3Q80VR2 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ell3Q80VR2 Hyal1-202ENSMUST00000112387 2706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ell3Q80VR2 Nop14-201ENSMUST00000041364 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ell3Q80VR2 Peg10-202ENSMUST00000176204 6667 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ell3Q80VR2 Btbd9-201ENSMUST00000079924 6657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ell3Q80VR2 Zcchc8-204ENSMUST00000196282 4350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ell3Q80VR2 Gm43522-201ENSMUST00000196697 1922 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Ell3Q80VR2 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ell3Q80VR2 Trim45-201ENSMUST00000037409 4612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ell3Q80VR2 Aak1-201ENSMUST00000003710 7203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ell3Q80VR2 Tbl2-204ENSMUST00000153183 7488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ell3Q80VR2 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ell3Q80VR2 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ell3Q80VR2 Mfrp-201ENSMUST00000034654 4316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ell3Q80VR2 Nras-201ENSMUST00000029445 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ell3Q80VR2 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
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