Protein–RNA interactions for Protein: Q78T54

Vma21, Vacuolar ATPase assembly integral membrane protein Vma21, mousemouse

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Length 101 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vma21Q78T54 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Vma21Q78T54 Osbp2-201ENSMUST00000070552 4097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Vma21Q78T54 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Vma21Q78T54 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Vma21Q78T54 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Vma21Q78T54 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Vma21Q78T54 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Vma21Q78T54 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Vma21Q78T54 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Vma21Q78T54 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Vma21Q78T54 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Vma21Q78T54 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Vma21Q78T54 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Vma21Q78T54 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Vma21Q78T54 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Vma21Q78T54 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Vma21Q78T54 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Vma21Q78T54 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Vma21Q78T54 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Vma21Q78T54 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Vma21Q78T54 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Vma21Q78T54 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Vma21Q78T54 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Vma21Q78T54 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Vma21Q78T54 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Vma21Q78T54 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Vma21Q78T54 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Vma21Q78T54 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Vma21Q78T54 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Vma21Q78T54 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Vma21Q78T54 Itsn2-211ENSMUST00000219007 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Vma21Q78T54 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Vma21Q78T54 Usp22-201ENSMUST00000041683 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Vma21Q78T54 Yeats2-202ENSMUST00000115560 6116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Vma21Q78T54 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Vma21Q78T54 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Vma21Q78T54 Plekhm1-201ENSMUST00000041272 5968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Vma21Q78T54 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Vma21Q78T54 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Vma21Q78T54 Gm43720-201ENSMUST00000159067 6411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Vma21Q78T54 Rnf165-202ENSMUST00000182024 4309 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Vma21Q78T54 Btbd9-201ENSMUST00000079924 6657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Vma21Q78T54 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Vma21Q78T54 Prag1-201ENSMUST00000110492 4780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Vma21Q78T54 Cpn2-201ENSMUST00000064856 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Vma21Q78T54 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Vma21Q78T54 Mei1-201ENSMUST00000089178 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Vma21Q78T54 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Vma21Q78T54 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Vma21Q78T54 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Vma21Q78T54 Rgr-203ENSMUST00000225070 4704 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Vma21Q78T54 Tie1-201ENSMUST00000047421 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Vma21Q78T54 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Vma21Q78T54 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Vma21Q78T54 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Vma21Q78T54 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Vma21Q78T54 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Vma21Q78T54 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Vma21Q78T54 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Vma21Q78T54 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Vma21Q78T54 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Vma21Q78T54 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
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Vma21Q78T54 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Vma21Q78T54 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Vma21Q78T54 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
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Vma21Q78T54 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Vma21Q78T54 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
Vma21Q78T54 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
Vma21Q78T54 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Vma21Q78T54 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Vma21Q78T54 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Vma21Q78T54 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Vma21Q78T54 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Vma21Q78T54 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Vma21Q78T54 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Vma21Q78T54 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
Vma21Q78T54 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
Vma21Q78T54 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Vma21Q78T54 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Vma21Q78T54 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Vma21Q78T54 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Vma21Q78T54 Rgs8-201ENSMUST00000041776 8474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Vma21Q78T54 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Vma21Q78T54 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Vma21Q78T54 Gm42463-201ENSMUST00000198041 4886 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Vma21Q78T54 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Vma21Q78T54 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Vma21Q78T54 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Vma21Q78T54 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Vma21Q78T54 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Vma21Q78T54 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Vma21Q78T54 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Vma21Q78T54 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Vma21Q78T54 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Vma21Q78T54 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Vma21Q78T54 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
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