Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDQ2

Chd4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,915 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chd4Q6PDQ2 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Chd4Q6PDQ2 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Chd4Q6PDQ2 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Chd4Q6PDQ2 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Chd4Q6PDQ2 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Chd4Q6PDQ2 4931415C17Rik-202ENSMUST00000131064 2255 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Chd4Q6PDQ2 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Chd4Q6PDQ2 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Chd4Q6PDQ2 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Chd4Q6PDQ2 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Chd4Q6PDQ2 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Chd4Q6PDQ2 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Chd4Q6PDQ2 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Chd4Q6PDQ2 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Chd4Q6PDQ2 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Chd4Q6PDQ2 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Chd4Q6PDQ2 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Chd4Q6PDQ2 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Chd4Q6PDQ2 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Chd4Q6PDQ2 Gm23272-201ENSMUST00000104053 129 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Chd4Q6PDQ2 4930471C06Rik-202ENSMUST00000143070 579 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Chd4Q6PDQ2 4930538E20Rik-202ENSMUST00000146717 497 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Chd4Q6PDQ2 AC159890.1-201ENSMUST00000215382 684 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Chd4Q6PDQ2 Cinp-204ENSMUST00000221102 536 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Chd4Q6PDQ2 Commd4-201ENSMUST00000065358 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Chd4Q6PDQ2 Naa10-202ENSMUST00000096316 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Chd4Q6PDQ2 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Chd4Q6PDQ2 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Chd4Q6PDQ2 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Chd4Q6PDQ2 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Chd4Q6PDQ2 Chit1-203ENSMUST00000160060 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Chd4Q6PDQ2 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Chd4Q6PDQ2 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Chd4Q6PDQ2 Snhg18-201ENSMUST00000181536 1486 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Chd4Q6PDQ2 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Chd4Q6PDQ2 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Chd4Q6PDQ2 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Chd4Q6PDQ2 Ism2-201ENSMUST00000051601 1350 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Chd4Q6PDQ2 Abi2-205ENSMUST00000187709 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Chd4Q6PDQ2 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Chd4Q6PDQ2 Gm15172-201ENSMUST00000118945 1046 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Chd4Q6PDQ2 Gm7150-201ENSMUST00000122032 981 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Chd4Q6PDQ2 Aamdc-203ENSMUST00000124552 618 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chd4Q6PDQ2 Isl1-202ENSMUST00000176044 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chd4Q6PDQ2 Csmd2os-202ENSMUST00000179945 643 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chd4Q6PDQ2 5830428M24Rik-201ENSMUST00000221805 825 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chd4Q6PDQ2 Crygs-201ENSMUST00000040592 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chd4Q6PDQ2 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chd4Q6PDQ2 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chd4Q6PDQ2 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chd4Q6PDQ2 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chd4Q6PDQ2 Clrn1-203ENSMUST00000072551 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chd4Q6PDQ2 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chd4Q6PDQ2 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chd4Q6PDQ2 Gm3765-201ENSMUST00000130985 1447 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Chd4Q6PDQ2 Tssk4-201ENSMUST00000007735 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chd4Q6PDQ2 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chd4Q6PDQ2 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chd4Q6PDQ2 Coa3-202ENSMUST00000168089 291 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chd4Q6PDQ2 Pmvk-204ENSMUST00000198440 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chd4Q6PDQ2 Gm3017-201ENSMUST00000203603 1126 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Chd4Q6PDQ2 Hils1-201ENSMUST00000038928 864 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chd4Q6PDQ2 Krtap4-2-201ENSMUST00000058987 974 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chd4Q6PDQ2 Pisd-203ENSMUST00000120591 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chd4Q6PDQ2 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chd4Q6PDQ2 Spdye4a-203ENSMUST00000195900 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chd4Q6PDQ2 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chd4Q6PDQ2 Catsper3-201ENSMUST00000021961 1330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chd4Q6PDQ2 Gm45199-201ENSMUST00000207640 1507 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Chd4Q6PDQ2 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chd4Q6PDQ2 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chd4Q6PDQ2 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chd4Q6PDQ2 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chd4Q6PDQ2 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chd4Q6PDQ2 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chd4Q6PDQ2 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chd4Q6PDQ2 9330111N05Rik-203ENSMUST00000181508 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chd4Q6PDQ2 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chd4Q6PDQ2 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chd4Q6PDQ2 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chd4Q6PDQ2 Gm14154-201ENSMUST00000142642 579 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chd4Q6PDQ2 Gm17135-201ENSMUST00000167009 564 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chd4Q6PDQ2 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chd4Q6PDQ2 1700008A23Rik-201ENSMUST00000191694 691 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Chd4Q6PDQ2 Gm17877-201ENSMUST00000192578 814 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Chd4Q6PDQ2 Olfr1380-201ENSMUST00000204300 938 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chd4Q6PDQ2 Gm8342-201ENSMUST00000209839 757 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Chd4Q6PDQ2 Gm45460-201ENSMUST00000211385 1038 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chd4Q6PDQ2 AC164618.2-201ENSMUST00000224770 573 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Chd4Q6PDQ2 Scg5-201ENSMUST00000024005 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chd4Q6PDQ2 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chd4Q6PDQ2 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chd4Q6PDQ2 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chd4Q6PDQ2 Prkaca-202ENSMUST00000211558 1399 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chd4Q6PDQ2 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chd4Q6PDQ2 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chd4Q6PDQ2 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chd4Q6PDQ2 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chd4Q6PDQ2 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chd4Q6PDQ2 Gm15615-201ENSMUST00000118876 198 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms