Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZK6

Jmjd1c, Probable JmjC domain-containing histone demethylation protein 2C, mousemouse

Predictions only

Length 2,350 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Jmjd1cQ69ZK6 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Jmjd1cQ69ZK6 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Jmjd1cQ69ZK6 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Jmjd1cQ69ZK6 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Jmjd1cQ69ZK6 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Jmjd1cQ69ZK6 Gm14724-201ENSMUST00000118400 537 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Jmjd1cQ69ZK6 0610037L13Rik-206ENSMUST00000120473 835 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Jmjd1cQ69ZK6 Gm20694-201ENSMUST00000176943 404 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Jmjd1cQ69ZK6 Ighv1-2-201ENSMUST00000195325 378 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Jmjd1cQ69ZK6 AC129308.3-201ENSMUST00000225652 524 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Jmjd1cQ69ZK6 Rps10-ps1-201ENSMUST00000074353 495 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Jmjd1cQ69ZK6 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Jmjd1cQ69ZK6 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Jmjd1cQ69ZK6 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Jmjd1cQ69ZK6 Gm5641-201ENSMUST00000091130 1488 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Jmjd1cQ69ZK6 Bpifb4-201ENSMUST00000099181 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Jmjd1cQ69ZK6 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Jmjd1cQ69ZK6 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Jmjd1cQ69ZK6 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Jmjd1cQ69ZK6 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Jmjd1cQ69ZK6 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Jmjd1cQ69ZK6 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Jmjd1cQ69ZK6 Ccm2-203ENSMUST00000109722 1760 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Jmjd1cQ69ZK6 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Jmjd1cQ69ZK6 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Jmjd1cQ69ZK6 Cbx7-202ENSMUST00000109615 710 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Jmjd1cQ69ZK6 Nptn-202ENSMUST00000114121 863 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Jmjd1cQ69ZK6 Gm5555-201ENSMUST00000120352 1111 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Jmjd1cQ69ZK6 AA387200-201ENSMUST00000147463 1177 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Jmjd1cQ69ZK6 Tnfrsf18-201ENSMUST00000040274 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Jmjd1cQ69ZK6 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Jmjd1cQ69ZK6 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Jmjd1cQ69ZK6 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Jmjd1cQ69ZK6 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Jmjd1cQ69ZK6 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Jmjd1cQ69ZK6 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Jmjd1cQ69ZK6 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Jmjd1cQ69ZK6 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Jmjd1cQ69ZK6 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Jmjd1cQ69ZK6 Gm38344-201ENSMUST00000195306 1353 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Jmjd1cQ69ZK6 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Jmjd1cQ69ZK6 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Jmjd1cQ69ZK6 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Jmjd1cQ69ZK6 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Jmjd1cQ69ZK6 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Jmjd1cQ69ZK6 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Jmjd1cQ69ZK6 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Jmjd1cQ69ZK6 Gm3415-201ENSMUST00000110595 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Jmjd1cQ69ZK6 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Jmjd1cQ69ZK6 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Jmjd1cQ69ZK6 Gm13267-201ENSMUST00000142787 698 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Jmjd1cQ69ZK6 Rrm2b-207ENSMUST00000146821 420 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Jmjd1cQ69ZK6 AC158605.1-201ENSMUST00000156803 764 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Jmjd1cQ69ZK6 Gm4462-201ENSMUST00000166453 492 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Jmjd1cQ69ZK6 BC025446-202ENSMUST00000185307 758 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Jmjd1cQ69ZK6 AC155712.2-201ENSMUST00000220398 643 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Jmjd1cQ69ZK6 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Jmjd1cQ69ZK6 AC187103.3-201ENSMUST00000225725 646 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Jmjd1cQ69ZK6 Mgp-201ENSMUST00000032342 617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Jmjd1cQ69ZK6 Gm3402-202ENSMUST00000077133 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Jmjd1cQ69ZK6 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Jmjd1cQ69ZK6 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Jmjd1cQ69ZK6 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Jmjd1cQ69ZK6 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Jmjd1cQ69ZK6 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Jmjd1cQ69ZK6 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Jmjd1cQ69ZK6 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Jmjd1cQ69ZK6 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Jmjd1cQ69ZK6 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Jmjd1cQ69ZK6 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Jmjd1cQ69ZK6 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Jmjd1cQ69ZK6 Trim34b-202ENSMUST00000180136 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Jmjd1cQ69ZK6 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Jmjd1cQ69ZK6 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Jmjd1cQ69ZK6 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Jmjd1cQ69ZK6 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Jmjd1cQ69ZK6 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Jmjd1cQ69ZK6 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Jmjd1cQ69ZK6 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Jmjd1cQ69ZK6 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Jmjd1cQ69ZK6 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Jmjd1cQ69ZK6 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Jmjd1cQ69ZK6 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Jmjd1cQ69ZK6 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Jmjd1cQ69ZK6 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Jmjd1cQ69ZK6 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Jmjd1cQ69ZK6 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Jmjd1cQ69ZK6 Mir6407-201ENSMUST00000184510 101 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Jmjd1cQ69ZK6 Rhoc-205ENSMUST00000196817 877 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Jmjd1cQ69ZK6 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Jmjd1cQ69ZK6 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Jmjd1cQ69ZK6 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Jmjd1cQ69ZK6 Rhox8-201ENSMUST00000071885 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Jmjd1cQ69ZK6 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Jmjd1cQ69ZK6 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Jmjd1cQ69ZK6 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Jmjd1cQ69ZK6 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Jmjd1cQ69ZK6 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Jmjd1cQ69ZK6 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Jmjd1cQ69ZK6 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms