Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

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Length 1,455 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ccdc18Q640L5 A530032D15Rik-201ENSMUST00000160792 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ccdc18Q640L5 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ccdc18Q640L5 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ccdc18Q640L5 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ccdc18Q640L5 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ccdc18Q640L5 Smim11-202ENSMUST00000118064 782 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ccdc18Q640L5 Cdpf1-205ENSMUST00000150995 566 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ccdc18Q640L5 Zfp637-210ENSMUST00000164472 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ccdc18Q640L5 AC238811.4-201ENSMUST00000178019 1246 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Ccdc18Q640L5 AC238940.3-201ENSMUST00000178830 1246 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Ccdc18Q640L5 D830035M03Rik-201ENSMUST00000213677 1041 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ccdc18Q640L5 Gm4811-201ENSMUST00000220879 1220 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Ccdc18Q640L5 CT009546.1-201ENSMUST00000222573 1120 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Ccdc18Q640L5 Crygs-201ENSMUST00000040592 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ccdc18Q640L5 AC130823.1-201ENSMUST00000228929 1549 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Ccdc18Q640L5 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Ccdc18Q640L5 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ccdc18Q640L5 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ccdc18Q640L5 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Ccdc18Q640L5 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ccdc18Q640L5 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ccdc18Q640L5 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ccdc18Q640L5 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ccdc18Q640L5 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ccdc18Q640L5 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ccdc18Q640L5 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ccdc18Q640L5 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ccdc18Q640L5 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Ccdc18Q640L5 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ccdc18Q640L5 Ighv5-9-201ENSMUST00000103448 418 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ccdc18Q640L5 Gm13351-201ENSMUST00000118087 414 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Ccdc18Q640L5 Gng8-202ENSMUST00000205459 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ccdc18Q640L5 Cdipt-204ENSMUST00000206346 806 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ccdc18Q640L5 Gm8436-201ENSMUST00000210152 1080 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Ccdc18Q640L5 Gm5749-201ENSMUST00000210673 1090 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Ccdc18Q640L5 Cplx3-203ENSMUST00000217015 540 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ccdc18Q640L5 Apoc4-201ENSMUST00000003071 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ccdc18Q640L5 Atp5h-201ENSMUST00000043931 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ccdc18Q640L5 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ccdc18Q640L5 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ccdc18Q640L5 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ccdc18Q640L5 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
Ccdc18Q640L5 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ccdc18Q640L5 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ccdc18Q640L5 Hddc3-201ENSMUST00000032747 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ccdc18Q640L5 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ccdc18Q640L5 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ccdc18Q640L5 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ccdc18Q640L5 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ccdc18Q640L5 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ccdc18Q640L5 Gm24791-201ENSMUST00000104284 131 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
Ccdc18Q640L5 Tomm5-201ENSMUST00000107807 442 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ccdc18Q640L5 Atp6v1g2-202ENSMUST00000118384 483 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ccdc18Q640L5 Gm13166-201ENSMUST00000123828 940 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ccdc18Q640L5 Smim20-201ENSMUST00000147148 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ccdc18Q640L5 Gm13236-201ENSMUST00000153010 940 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ccdc18Q640L5 Nudt12-203ENSMUST00000174122 1244 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ccdc18Q640L5 Tmbim7-204ENSMUST00000198739 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ccdc18Q640L5 Gm45592-201ENSMUST00000209605 1043 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
Ccdc18Q640L5 Gm4924-205ENSMUST00000211099 490 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ccdc18Q640L5 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ccdc18Q640L5 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ccdc18Q640L5 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
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Ccdc18Q640L5 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ccdc18Q640L5 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
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Ccdc18Q640L5 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ccdc18Q640L5 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ccdc18Q640L5 E330011O21Rik-202ENSMUST00000209498 1403 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
Ccdc18Q640L5 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Ccdc18Q640L5 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Ccdc18Q640L5 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Ccdc18Q640L5 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Ccdc18Q640L5 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ccdc18Q640L5 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ccdc18Q640L5 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ccdc18Q640L5 Ice2-202ENSMUST00000117246 1201 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ccdc18Q640L5 Marcksl1-ps4-201ENSMUST00000132531 291 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
Ccdc18Q640L5 Gm16876-201ENSMUST00000151945 760 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ccdc18Q640L5 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ccdc18Q640L5 Gm21844-201ENSMUST00000178699 663 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ccdc18Q640L5 Gm35025-203ENSMUST00000193519 634 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ccdc18Q640L5 Rnf183-201ENSMUST00000079420 573 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ccdc18Q640L5 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ccdc18Q640L5 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ccdc18Q640L5 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ccdc18Q640L5 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ccdc18Q640L5 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ccdc18Q640L5 Snai2-201ENSMUST00000023356 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ccdc18Q640L5 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ccdc18Q640L5 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ccdc18Q640L5 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ccdc18Q640L5 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ccdc18Q640L5 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ccdc18Q640L5 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ccdc18Q640L5 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ccdc18Q640L5 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ccdc18Q640L5 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
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