Protein–RNA interactions for Protein: Q62318

Trim28, Transcription intermediary factor 1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 834 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Trim28Q62318 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim28Q62318 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim28Q62318 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim28Q62318 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim28Q62318 Gm8522-201ENSMUST00000118416 1929 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
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Trim28Q62318 Drd3-201ENSMUST00000023390 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim28Q62318 Cdc42ep2-201ENSMUST00000055458 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim28Q62318 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim28Q62318 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim28Q62318 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Trim28Q62318 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Trim28Q62318 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Trim28Q62318 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Trim28Q62318 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Trim28Q62318 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Trim28Q62318 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Trim28Q62318 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Trim28Q62318 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Trim28Q62318 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Trim28Q62318 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Trim28Q62318 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
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