Protein–RNA interactions for Protein: Q61457

Ccne1, G1/S-specific cyclin-E1, mousemouse

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccne1Q61457 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ccne1Q61457 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ccne1Q61457 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ccne1Q61457 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ccne1Q61457 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ccne1Q61457 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ccne1Q61457 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccne1Q61457 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccne1Q61457 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccne1Q61457 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccne1Q61457 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccne1Q61457 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccne1Q61457 Cyb5rl-202ENSMUST00000106756 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccne1Q61457 Rwdd3-205ENSMUST00000106467 1158 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccne1Q61457 Gm15595-201ENSMUST00000120840 961 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccne1Q61457 Gm14965-201ENSMUST00000124118 565 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccne1Q61457 Pcbd2-202ENSMUST00000124968 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccne1Q61457 Gm15972-201ENSMUST00000132571 418 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccne1Q61457 Gm15881-201ENSMUST00000148792 942 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccne1Q61457 Tspo2-205ENSMUST00000162481 473 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccne1Q61457 Higd1c-201ENSMUST00000175683 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccne1Q61457 CT030637.1-201ENSMUST00000228016 669 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccne1Q61457 AC159103.1-201ENSMUST00000228325 429 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccne1Q61457 Gm5705-201ENSMUST00000066241 711 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccne1Q61457 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccne1Q61457 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccne1Q61457 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccne1Q61457 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccne1Q61457 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccne1Q61457 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccne1Q61457 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccne1Q61457 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccne1Q61457 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccne1Q61457 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccne1Q61457 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccne1Q61457 Gm10152-201ENSMUST00000193475 1344 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccne1Q61457 Gm9387-201ENSMUST00000098624 1320 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccne1Q61457 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccne1Q61457 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccne1Q61457 Pisd-ps2-201ENSMUST00000127960 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccne1Q61457 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccne1Q61457 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccne1Q61457 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccne1Q61457 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccne1Q61457 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccne1Q61457 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccne1Q61457 Gm5419-201ENSMUST00000119301 527 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccne1Q61457 Gm14460-201ENSMUST00000121511 639 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccne1Q61457 Anp32a-205ENSMUST00000135395 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccne1Q61457 Gm10752-201ENSMUST00000218348 729 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccne1Q61457 Gm14150-201ENSMUST00000122404 1354 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccne1Q61457 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccne1Q61457 Dph7-201ENSMUST00000028351 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccne1Q61457 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccne1Q61457 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccne1Q61457 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccne1Q61457 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccne1Q61457 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccne1Q61457 Mak-202ENSMUST00000070193 2937 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccne1Q61457 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccne1Q61457 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccne1Q61457 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccne1Q61457 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccne1Q61457 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccne1Q61457 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccne1Q61457 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccne1Q61457 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccne1Q61457 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccne1Q61457 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccne1Q61457 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccne1Q61457 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccne1Q61457 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccne1Q61457 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccne1Q61457 Rps2-ps4-201ENSMUST00000121977 633 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccne1Q61457 Gm3948-201ENSMUST00000147795 421 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccne1Q61457 Gm13523-201ENSMUST00000151820 488 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccne1Q61457 C730034F03Rik-201ENSMUST00000168646 1280 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccne1Q61457 Plac9a-202ENSMUST00000183431 536 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccne1Q61457 Plac9b-204ENSMUST00000184675 536 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccne1Q61457 Gm28516-201ENSMUST00000190257 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccne1Q61457 A430050A11Rik-201ENSMUST00000195348 646 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccne1Q61457 Gm8365-201ENSMUST00000197334 648 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccne1Q61457 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccne1Q61457 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccne1Q61457 AC134869.3-201ENSMUST00000225581 343 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccne1Q61457 Actg-ps1-201ENSMUST00000099636 1124 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccne1Q61457 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccne1Q61457 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccne1Q61457 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccne1Q61457 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccne1Q61457 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccne1Q61457 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccne1Q61457 Pcgf2-202ENSMUST00000103148 1438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccne1Q61457 Slc14a2-202ENSMUST00000163367 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccne1Q61457 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccne1Q61457 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccne1Q61457 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccne1Q61457 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccne1Q61457 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccne1Q61457 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms