Protein–RNA interactions for Protein: Q60673

Ptprn, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, mousemouse

Predictions only

Length 979 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprnQ60673 Gm43947-201ENSMUST00000203019 959 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
PtprnQ60673 Olfr1480-203ENSMUST00000207904 1209 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.42
PtprnQ60673 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
PtprnQ60673 Atp6v1g1-201ENSMUST00000035301 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PtprnQ60673 Olfr845-201ENSMUST00000071259 942 ntAPPRIS P1 BASIC12.42□□□□□ -0.42
PtprnQ60673 Olfr1480-201ENSMUST00000072219 948 ntAPPRIS P1 BASIC12.42□□□□□ -0.42
PtprnQ60673 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PtprnQ60673 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
PtprnQ60673 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PtprnQ60673 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PtprnQ60673 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PtprnQ60673 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PtprnQ60673 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PtprnQ60673 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PtprnQ60673 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
PtprnQ60673 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
PtprnQ60673 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PtprnQ60673 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PtprnQ60673 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PtprnQ60673 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
PtprnQ60673 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PtprnQ60673 Sun1-203ENSMUST00000100517 1522 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PtprnQ60673 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PtprnQ60673 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
PtprnQ60673 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PtprnQ60673 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PtprnQ60673 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PtprnQ60673 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PtprnQ60673 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
PtprnQ60673 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PtprnQ60673 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PtprnQ60673 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
PtprnQ60673 Gngt2-207ENSMUST00000107714 558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
PtprnQ60673 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
PtprnQ60673 Pdlim2-204ENSMUST00000127836 920 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
PtprnQ60673 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
PtprnQ60673 1700084C06Rik-201ENSMUST00000135674 750 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PtprnQ60673 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PtprnQ60673 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
PtprnQ60673 Ppp1r2-ps9-202ENSMUST00000173852 882 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
PtprnQ60673 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
PtprnQ60673 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PtprnQ60673 1600019K03Rik-201ENSMUST00000187829 477 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PtprnQ60673 1700022E09Rik-202ENSMUST00000188342 387 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PtprnQ60673 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PtprnQ60673 Gm38280-201ENSMUST00000192610 158 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
PtprnQ60673 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
PtprnQ60673 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
PtprnQ60673 AC165256.1-201ENSMUST00000216687 670 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
PtprnQ60673 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
PtprnQ60673 AC153522.1-201ENSMUST00000220047 1090 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
PtprnQ60673 AC158388.1-201ENSMUST00000225441 256 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
PtprnQ60673 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PtprnQ60673 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC12.41□□□□□ -0.42
PtprnQ60673 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PtprnQ60673 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PtprnQ60673 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PtprnQ60673 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
PtprnQ60673 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PtprnQ60673 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PtprnQ60673 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PtprnQ60673 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PtprnQ60673 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PtprnQ60673 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PtprnQ60673 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
PtprnQ60673 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
PtprnQ60673 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PtprnQ60673 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PtprnQ60673 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PtprnQ60673 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
PtprnQ60673 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
PtprnQ60673 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PtprnQ60673 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PtprnQ60673 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
PtprnQ60673 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
PtprnQ60673 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PtprnQ60673 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PtprnQ60673 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PtprnQ60673 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
PtprnQ60673 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PtprnQ60673 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PtprnQ60673 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PtprnQ60673 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PtprnQ60673 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PtprnQ60673 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
PtprnQ60673 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
PtprnQ60673 Gm12714-201ENSMUST00000143391 669 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
PtprnQ60673 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PtprnQ60673 Gm16133-202ENSMUST00000160278 565 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
PtprnQ60673 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
PtprnQ60673 Gm19585-201ENSMUST00000186007 587 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
PtprnQ60673 Gm17983-201ENSMUST00000190766 594 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
PtprnQ60673 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
PtprnQ60673 Gm44845-201ENSMUST00000208773 335 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
PtprnQ60673 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PtprnQ60673 AC153899.1-201ENSMUST00000214092 1117 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
PtprnQ60673 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PtprnQ60673 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PtprnQ60673 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PtprnQ60673 Psmb7-201ENSMUST00000028083 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45 ms