Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIR1

Trappc13, Trafficking protein particle complex subunit 13, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc13Q3TIR1 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Trappc13Q3TIR1 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Trappc13Q3TIR1 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Trappc13Q3TIR1 Cald1-205ENSMUST00000115027 4777 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Trappc13Q3TIR1 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Trappc13Q3TIR1 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Trappc13Q3TIR1 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Trappc13Q3TIR1 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Trappc13Q3TIR1 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Trappc13Q3TIR1 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Trappc13Q3TIR1 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Trappc13Q3TIR1 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Trappc13Q3TIR1 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Trappc13Q3TIR1 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Trappc13Q3TIR1 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Trappc13Q3TIR1 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Trappc13Q3TIR1 Gm45053-201ENSMUST00000206112 2499 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Trappc13Q3TIR1 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Trappc13Q3TIR1 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Trappc13Q3TIR1 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Trappc13Q3TIR1 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Trappc13Q3TIR1 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Trappc13Q3TIR1 Lmbr1-202ENSMUST00000179191 4836 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Trappc13Q3TIR1 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Trappc13Q3TIR1 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Trappc13Q3TIR1 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Trappc13Q3TIR1 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Trappc13Q3TIR1 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Trappc13Q3TIR1 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Trappc13Q3TIR1 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Trappc13Q3TIR1 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Trappc13Q3TIR1 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Trappc13Q3TIR1 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Trappc13Q3TIR1 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Trappc13Q3TIR1 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Trappc13Q3TIR1 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Trappc13Q3TIR1 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Trappc13Q3TIR1 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Trappc13Q3TIR1 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Trappc13Q3TIR1 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Trappc13Q3TIR1 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Trappc13Q3TIR1 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Trappc13Q3TIR1 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Trappc13Q3TIR1 Dhx30-212ENSMUST00000197928 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Trappc13Q3TIR1 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Trappc13Q3TIR1 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Trappc13Q3TIR1 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Trappc13Q3TIR1 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Trappc13Q3TIR1 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Trappc13Q3TIR1 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Trappc13Q3TIR1 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Trappc13Q3TIR1 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Trappc13Q3TIR1 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Trappc13Q3TIR1 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Trappc13Q3TIR1 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Trappc13Q3TIR1 Ly75-202ENSMUST00000112533 6901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Trappc13Q3TIR1 Tom1l2-202ENSMUST00000093046 4849 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Trappc13Q3TIR1 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Trappc13Q3TIR1 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Trappc13Q3TIR1 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Trappc13Q3TIR1 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Trappc13Q3TIR1 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Trappc13Q3TIR1 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Trappc13Q3TIR1 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Trappc13Q3TIR1 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Trappc13Q3TIR1 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Trappc13Q3TIR1 Dcc-202ENSMUST00000114943 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Trappc13Q3TIR1 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Trappc13Q3TIR1 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Trappc13Q3TIR1 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Trappc13Q3TIR1 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Trappc13Q3TIR1 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Trappc13Q3TIR1 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Trappc13Q3TIR1 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Trappc13Q3TIR1 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Trappc13Q3TIR1 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Trappc13Q3TIR1 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Trappc13Q3TIR1 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Trappc13Q3TIR1 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Trappc13Q3TIR1 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Trappc13Q3TIR1 Kank4-201ENSMUST00000102790 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Trappc13Q3TIR1 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Trappc13Q3TIR1 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Trappc13Q3TIR1 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Trappc13Q3TIR1 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Trappc13Q3TIR1 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Trappc13Q3TIR1 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Trappc13Q3TIR1 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Trappc13Q3TIR1 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Trappc13Q3TIR1 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Trappc13Q3TIR1 Acly-201ENSMUST00000007131 4393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Trappc13Q3TIR1 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Trappc13Q3TIR1 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Trappc13Q3TIR1 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Trappc13Q3TIR1 Gja8-201ENSMUST00000062944 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Trappc13Q3TIR1 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Trappc13Q3TIR1 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Trappc13Q3TIR1 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Trappc13Q3TIR1 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Trappc13Q3TIR1 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms