Protein–RNA interactions for Protein: Q32KG4

Rtl9, Retrotransposon Gag-like protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,339 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Rtl9Q32KG4 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Rtl9Q32KG4 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rtl9Q32KG4 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rtl9Q32KG4 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rtl9Q32KG4 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rtl9Q32KG4 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rtl9Q32KG4 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rtl9Q32KG4 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rtl9Q32KG4 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Rtl9Q32KG4 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rtl9Q32KG4 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rtl9Q32KG4 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rtl9Q32KG4 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rtl9Q32KG4 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Rtl9Q32KG4 Gm9678-201ENSMUST00000198979 1149 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Rtl9Q32KG4 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rtl9Q32KG4 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rtl9Q32KG4 Mettl5-201ENSMUST00000060447 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rtl9Q32KG4 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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