Protein–RNA interactions for Protein: Q30D77

Col24a1, Collagen alpha-1(XXIV) chain, mousemouse

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Length 1,733 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col24a1Q30D77 Rnf181-202ENSMUST00000069595 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Col24a1Q30D77 Mkrn1-ps1-201ENSMUST00000122035 1390 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Col24a1Q30D77 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Col24a1Q30D77 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Col24a1Q30D77 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Col24a1Q30D77 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Col24a1Q30D77 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Col24a1Q30D77 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Col24a1Q30D77 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Col24a1Q30D77 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Col24a1Q30D77 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Col24a1Q30D77 Gm9796-201ENSMUST00000062249 2250 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Col24a1Q30D77 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Col24a1Q30D77 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Col24a1Q30D77 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Col24a1Q30D77 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Col24a1Q30D77 Brcc3-203ENSMUST00000118428 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Col24a1Q30D77 Gm14113-201ENSMUST00000121399 976 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Col24a1Q30D77 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Col24a1Q30D77 Tnnc1-202ENSMUST00000169169 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Col24a1Q30D77 Gm13290-201ENSMUST00000177806 968 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Col24a1Q30D77 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Col24a1Q30D77 Rhox12-203ENSMUST00000183737 761 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Col24a1Q30D77 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Col24a1Q30D77 Gm5308-201ENSMUST00000196752 1354 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Col24a1Q30D77 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Col24a1Q30D77 Snx27-208ENSMUST00000200642 1308 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
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Col24a1Q30D77 Map7-203ENSMUST00000213312 795 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Col24a1Q30D77 Chordc1-202ENSMUST00000213605 519 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Col24a1Q30D77 Gm9102-201ENSMUST00000219250 465 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Col24a1Q30D77 AC122035.1-201ENSMUST00000227576 1016 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Col24a1Q30D77 AC154213.1-201ENSMUST00000228234 583 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Col24a1Q30D77 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Col24a1Q30D77 Gm6304-201ENSMUST00000096579 447 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Col24a1Q30D77 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Col24a1Q30D77 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Col24a1Q30D77 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Col24a1Q30D77 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Col24a1Q30D77 Adam20-201ENSMUST00000056331 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Col24a1Q30D77 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Col24a1Q30D77 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Col24a1Q30D77 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Col24a1Q30D77 Ccm2-203ENSMUST00000109722 1760 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Col24a1Q30D77 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Col24a1Q30D77 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Col24a1Q30D77 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Col24a1Q30D77 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Col24a1Q30D77 Gm39204-201ENSMUST00000210045 1307 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Col24a1Q30D77 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Col24a1Q30D77 Cav2-203ENSMUST00000115462 694 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Col24a1Q30D77 Sfi1-204ENSMUST00000118627 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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Col24a1Q30D77 Eif5a-212ENSMUST00000153652 840 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Col24a1Q30D77 Gm17207-201ENSMUST00000168686 645 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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Col24a1Q30D77 Gm2474-201ENSMUST00000195162 559 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Col24a1Q30D77 Gm43244-201ENSMUST00000196994 1285 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
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Col24a1Q30D77 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Col24a1Q30D77 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Col24a1Q30D77 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Col24a1Q30D77 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Col24a1Q30D77 Pfkfb3-202ENSMUST00000049849 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Col24a1Q30D77 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Col24a1Q30D77 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Col24a1Q30D77 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Col24a1Q30D77 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Col24a1Q30D77 Gadl1-202ENSMUST00000119291 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Col24a1Q30D77 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Col24a1Q30D77 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Col24a1Q30D77 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Col24a1Q30D77 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Col24a1Q30D77 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Col24a1Q30D77 Plut-202ENSMUST00000174285 1444 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Col24a1Q30D77 Ncmap-201ENSMUST00000064481 1448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Col24a1Q30D77 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Col24a1Q30D77 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Col24a1Q30D77 5830437K03Rik-201ENSMUST00000199219 1379 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Col24a1Q30D77 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Col24a1Q30D77 Gm16209-201ENSMUST00000118457 627 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Col24a1Q30D77 Gm11736-201ENSMUST00000121468 505 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Col24a1Q30D77 Gm10171-201ENSMUST00000126220 628 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Col24a1Q30D77 Gm12705-201ENSMUST00000129460 872 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Col24a1Q30D77 Gm27191-201ENSMUST00000145973 448 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Col24a1Q30D77 Gm26313-201ENSMUST00000157770 308 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.9 ms