Protein–RNA interactions for Protein: Q1A3B0

Cers3, Ceramide synthase 3, mousemouse

Predictions only

Length 383 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cers3Q1A3B0 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cers3Q1A3B0 Mir680-2-201ENSMUST00000102163 110 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Cers3Q1A3B0 Gm23251-201ENSMUST00000103773 110 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Cers3Q1A3B0 Dusp13-204ENSMUST00000120984 976 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cers3Q1A3B0 Gm14662-201ENSMUST00000145552 734 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cers3Q1A3B0 Cd63-ps-202ENSMUST00000154992 717 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Cers3Q1A3B0 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cers3Q1A3B0 Gm8100-201ENSMUST00000182906 988 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Cers3Q1A3B0 Gm19353-201ENSMUST00000184561 445 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Cers3Q1A3B0 Gm8956-201ENSMUST00000203939 825 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Cers3Q1A3B0 Gm6905-201ENSMUST00000205729 511 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Cers3Q1A3B0 Gm4607-201ENSMUST00000206649 577 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Cers3Q1A3B0 AC159819.2-201ENSMUST00000216151 342 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Cers3Q1A3B0 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cers3Q1A3B0 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cers3Q1A3B0 Atp6v1g1-201ENSMUST00000035301 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cers3Q1A3B0 Ntng1-201ENSMUST00000051253 327 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Cers3Q1A3B0 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cers3Q1A3B0 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cers3Q1A3B0 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cers3Q1A3B0 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Cers3Q1A3B0 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cers3Q1A3B0 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cers3Q1A3B0 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cers3Q1A3B0 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cers3Q1A3B0 Grm5-201ENSMUST00000107263 3516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cers3Q1A3B0 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cers3Q1A3B0 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cers3Q1A3B0 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cers3Q1A3B0 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cers3Q1A3B0 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cers3Q1A3B0 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cers3Q1A3B0 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cers3Q1A3B0 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cers3Q1A3B0 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cers3Q1A3B0 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cers3Q1A3B0 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cers3Q1A3B0 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cers3Q1A3B0 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cers3Q1A3B0 Gm14396-201ENSMUST00000126966 548 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cers3Q1A3B0 Mir1943-201ENSMUST00000158276 73 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Cers3Q1A3B0 Gm23699-201ENSMUST00000158835 135 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Cers3Q1A3B0 Krtap20-2-201ENSMUST00000169954 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cers3Q1A3B0 Smpd4-223ENSMUST00000172182 516 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cers3Q1A3B0 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cers3Q1A3B0 Gm28375-201ENSMUST00000185304 430 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cers3Q1A3B0 Mir124-2hg-207ENSMUST00000189868 535 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cers3Q1A3B0 A630035G10Rik-202ENSMUST00000194468 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cers3Q1A3B0 Saa2-202ENSMUST00000210272 511 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cers3Q1A3B0 CT009713.8-201ENSMUST00000225448 560 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Cers3Q1A3B0 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cers3Q1A3B0 Cmtm2b-201ENSMUST00000041973 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cers3Q1A3B0 Rpl10a-201ENSMUST00000042334 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cers3Q1A3B0 Cd79b-201ENSMUST00000044228 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cers3Q1A3B0 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cers3Q1A3B0 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cers3Q1A3B0 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cers3Q1A3B0 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cers3Q1A3B0 B430119L08Rik-201ENSMUST00000130054 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cers3Q1A3B0 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cers3Q1A3B0 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cers3Q1A3B0 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cers3Q1A3B0 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cers3Q1A3B0 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cers3Q1A3B0 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cers3Q1A3B0 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cers3Q1A3B0 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cers3Q1A3B0 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Cers3Q1A3B0 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cers3Q1A3B0 Ddah1-202ENSMUST00000120310 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cers3Q1A3B0 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cers3Q1A3B0 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cers3Q1A3B0 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cers3Q1A3B0 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cers3Q1A3B0 Ifitm10-203ENSMUST00000105988 824 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cers3Q1A3B0 Gm12857-201ENSMUST00000117678 592 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Cers3Q1A3B0 Gm8566-201ENSMUST00000120174 465 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Cers3Q1A3B0 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Cers3Q1A3B0 Cryzl1-204ENSMUST00000122254 845 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cers3Q1A3B0 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cers3Q1A3B0 A430027H14Rik-202ENSMUST00000192797 618 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cers3Q1A3B0 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cers3Q1A3B0 Olfr1250-201ENSMUST00000099768 1139 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cers3Q1A3B0 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cers3Q1A3B0 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cers3Q1A3B0 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cers3Q1A3B0 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cers3Q1A3B0 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cers3Q1A3B0 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cers3Q1A3B0 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cers3Q1A3B0 AC091458.1-201ENSMUST00000220902 1361 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Cers3Q1A3B0 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cers3Q1A3B0 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cers3Q1A3B0 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cers3Q1A3B0 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cers3Q1A3B0 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cers3Q1A3B0 Pex26-202ENSMUST00000118234 3778 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cers3Q1A3B0 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cers3Q1A3B0 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
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