Protein–RNA interactions for Protein: P49813

Tmod1, Tropomodulin-1, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod1P49813 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tmod1P49813 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tmod1P49813 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tmod1P49813 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Tmod1P49813 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Tmod1P49813 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
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Tmod1P49813 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tmod1P49813 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tmod1P49813 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tmod1P49813 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tmod1P49813 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tmod1P49813 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tmod1P49813 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tmod1P49813 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Tmod1P49813 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tmod1P49813 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
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Tmod1P49813 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tmod1P49813 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tmod1P49813 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Tmod1P49813 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Tmod1P49813 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tmod1P49813 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
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Tmod1P49813 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
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Tmod1P49813 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tmod1P49813 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tmod1P49813 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tmod1P49813 Aprt-ps-201ENSMUST00000212311 505 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Tmod1P49813 Cdc34-208ENSMUST00000219791 799 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tmod1P49813 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tmod1P49813 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tmod1P49813 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tmod1P49813 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tmod1P49813 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tmod1P49813 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tmod1P49813 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Tmod1P49813 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tmod1P49813 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tmod1P49813 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tmod1P49813 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tmod1P49813 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tmod1P49813 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tmod1P49813 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tmod1P49813 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tmod1P49813 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tmod1P49813 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tmod1P49813 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tmod1P49813 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tmod1P49813 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tmod1P49813 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tmod1P49813 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tmod1P49813 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tmod1P49813 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tmod1P49813 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tmod1P49813 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tmod1P49813 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tmod1P49813 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
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Tmod1P49813 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
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Tmod1P49813 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tmod1P49813 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tmod1P49813 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tmod1P49813 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tmod1P49813 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tmod1P49813 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tmod1P49813 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tmod1P49813 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tmod1P49813 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tmod1P49813 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tmod1P49813 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tmod1P49813 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tmod1P49813 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tmod1P49813 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.23
Tmod1P49813 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Tmod1P49813 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tmod1P49813 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tmod1P49813 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tmod1P49813 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tmod1P49813 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tmod1P49813 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Tmod1P49813 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tmod1P49813 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tmod1P49813 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tmod1P49813 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tmod1P49813 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Tmod1P49813 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tmod1P49813 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tmod1P49813 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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