Protein–RNA interactions for Protein: P49446

Ptpre, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, mousemouse

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Length 699 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpreP49446 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PtpreP49446 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
PtpreP49446 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
PtpreP49446 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
PtpreP49446 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
PtpreP49446 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
PtpreP49446 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
PtpreP49446 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
PtpreP49446 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
PtpreP49446 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
PtpreP49446 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC13.79□□□□□ -0.2
PtpreP49446 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
PtpreP49446 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
PtpreP49446 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
PtpreP49446 Ttc4-202ENSMUST00000106772 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
PtpreP49446 Avpr2-203ENSMUST00000114395 936 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
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PtpreP49446 9430065F17Rik-202ENSMUST00000180908 1084 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
PtpreP49446 Gm28215-201ENSMUST00000186146 346 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
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PtpreP49446 1700003C15Rik-202ENSMUST00000188236 710 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
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PtpreP49446 6430710M23Rik-201ENSMUST00000210843 1191 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
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PtpreP49446 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
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PtpreP49446 Rpl17-201ENSMUST00000079716 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
PtpreP49446 1110025L11Rik-201ENSMUST00000089104 591 ntAPPRIS P1 BASIC13.79□□□□□ -0.2
PtpreP49446 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
PtpreP49446 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
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PtpreP49446 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
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PtpreP49446 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
PtpreP49446 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
PtpreP49446 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
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PtpreP49446 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
PtpreP49446 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
PtpreP49446 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
PtpreP49446 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
PtpreP49446 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
PtpreP49446 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
PtpreP49446 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
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PtpreP49446 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
PtpreP49446 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
PtpreP49446 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PtpreP49446 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PtpreP49446 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PtpreP49446 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PtpreP49446 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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PtpreP49446 Clrn1-201ENSMUST00000051408 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PtpreP49446 Defb36-201ENSMUST00000058086 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PtpreP49446 Rsg1-201ENSMUST00000097813 985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
PtpreP49446 Tepp-201ENSMUST00000098480 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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PtpreP49446 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PtpreP49446 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PtpreP49446 Cyp4x1-201ENSMUST00000051400 1524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PtpreP49446 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PtpreP49446 Gm3830-201ENSMUST00000185540 1715 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PtpreP49446 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
PtpreP49446 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PtpreP49446 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PtpreP49446 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PtpreP49446 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PtpreP49446 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PtpreP49446 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PtpreP49446 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
PtpreP49446 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
PtpreP49446 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
PtpreP49446 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
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