Protein–RNA interactions for Protein: P46935

Nedd4, E3 ubiquitin-protein ligase NEDD4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 887 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd4P46935 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nedd4P46935 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Nedd4P46935 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nedd4P46935 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nedd4P46935 Acrbp-204ENSMUST00000112413 672 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nedd4P46935 Gm12218-201ENSMUST00000117666 399 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Nedd4P46935 Gm21987-201ENSMUST00000119704 456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nedd4P46935 Smim1-204ENSMUST00000130175 477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nedd4P46935 AA672651-201ENSMUST00000151550 489 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nedd4P46935 Apoe-210ENSMUST00000174710 514 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nedd4P46935 Ly6e-203ENSMUST00000185861 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nedd4P46935 Gm28166-201ENSMUST00000187637 620 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nedd4P46935 Gm29499-201ENSMUST00000189151 486 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Nedd4P46935 Gm28329-201ENSMUST00000191208 689 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Nedd4P46935 Gm29171-201ENSMUST00000191397 486 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Nedd4P46935 1700008A23Rik-201ENSMUST00000191694 691 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Nedd4P46935 Gm37800-202ENSMUST00000193667 553 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nedd4P46935 Gm4924-205ENSMUST00000211099 490 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nedd4P46935 AC124433.1-201ENSMUST00000224483 1063 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Nedd4P46935 AC136376.2-201ENSMUST00000228819 490 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Nedd4P46935 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nedd4P46935 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nedd4P46935 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nedd4P46935 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nedd4P46935 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nedd4P46935 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nedd4P46935 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nedd4P46935 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nedd4P46935 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nedd4P46935 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nedd4P46935 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nedd4P46935 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nedd4P46935 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nedd4P46935 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nedd4P46935 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nedd4P46935 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nedd4P46935 Fam3a-201ENSMUST00000015427 1427 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nedd4P46935 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nedd4P46935 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nedd4P46935 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nedd4P46935 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nedd4P46935 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nedd4P46935 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nedd4P46935 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nedd4P46935 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nedd4P46935 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nedd4P46935 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nedd4P46935 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nedd4P46935 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nedd4P46935 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nedd4P46935 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nedd4P46935 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nedd4P46935 Gm10681-202ENSMUST00000178221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nedd4P46935 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nedd4P46935 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nedd4P46935 Gm11422-201ENSMUST00000118925 1103 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Nedd4P46935 Gm21972-201ENSMUST00000135197 776 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Nedd4P46935 Gm37013-201ENSMUST00000194544 313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nedd4P46935 4930413E15Rik-201ENSMUST00000202500 1290 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nedd4P46935 Gm8956-201ENSMUST00000203939 825 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Nedd4P46935 Gm9508-201ENSMUST00000220084 693 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Nedd4P46935 Rpl4-201ENSMUST00000034966 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Nedd4P46935 Gm26783-201ENSMUST00000181197 2377 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Nedd4P46935 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nedd4P46935 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nedd4P46935 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nedd4P46935 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Nedd4P46935 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nedd4P46935 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nedd4P46935 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nedd4P46935 Ypel4-201ENSMUST00000090729 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nedd4P46935 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nedd4P46935 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nedd4P46935 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nedd4P46935 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nedd4P46935 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nedd4P46935 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nedd4P46935 Rpl23-201ENSMUST00000103146 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nedd4P46935 Gm22711-201ENSMUST00000116890 133 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
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Nedd4P46935 Gm14942-201ENSMUST00000119642 336 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Nedd4P46935 Gm13267-201ENSMUST00000142787 698 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nedd4P46935 A930005H10Rik-204ENSMUST00000185681 625 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nedd4P46935 A930005H10Rik-206ENSMUST00000188260 739 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nedd4P46935 Gm18460-201ENSMUST00000208088 464 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Nedd4P46935 Gm45441-202ENSMUST00000209301 1235 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nedd4P46935 AC134328.1-201ENSMUST00000222693 667 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nedd4P46935 BC030499-201ENSMUST00000046361 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nedd4P46935 Mcts2-201ENSMUST00000062148 917 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nedd4P46935 Gm5805-201ENSMUST00000072779 456 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Nedd4P46935 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nedd4P46935 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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