Protein–RNA interactions for Protein: P42580

Nkx1-2, NK1 transcription factor-related protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx1-2P42580 Hdc-201ENSMUST00000028838 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nkx1-2P42580 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nkx1-2P42580 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nkx1-2P42580 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nkx1-2P42580 Trim55-201ENSMUST00000029139 2595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nkx1-2P42580 Tnip1-202ENSMUST00000102730 2787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nkx1-2P42580 Zfp941-201ENSMUST00000080651 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nkx1-2P42580 Asl-203ENSMUST00000160129 2413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nkx1-2P42580 Dtx3l-202ENSMUST00000114885 2648 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nkx1-2P42580 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nkx1-2P42580 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nkx1-2P42580 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nkx1-2P42580 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nkx1-2P42580 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nkx1-2P42580 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nkx1-2P42580 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nkx1-2P42580 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nkx1-2P42580 Slc38a3-202ENSMUST00000167868 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nkx1-2P42580 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nkx1-2P42580 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nkx1-2P42580 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nkx1-2P42580 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nkx1-2P42580 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nkx1-2P42580 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nkx1-2P42580 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nkx1-2P42580 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nkx1-2P42580 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Nkx1-2P42580 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nkx1-2P42580 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Nkx1-2P42580 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Nkx1-2P42580 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nkx1-2P42580 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nkx1-2P42580 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nkx1-2P42580 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nkx1-2P42580 Crispld2-201ENSMUST00000034282 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nkx1-2P42580 Parp9-203ENSMUST00000114878 3548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nkx1-2P42580 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nkx1-2P42580 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nkx1-2P42580 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nkx1-2P42580 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nkx1-2P42580 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nkx1-2P42580 Tcirg1-204ENSMUST00000126070 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nkx1-2P42580 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nkx1-2P42580 Pros1-201ENSMUST00000023629 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nkx1-2P42580 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nkx1-2P42580 Slx4ip-206ENSMUST00000180277 2723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nkx1-2P42580 Pcdh12-203ENSMUST00000194012 2702 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nkx1-2P42580 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nkx1-2P42580 Gm14169-201ENSMUST00000124676 2519 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nkx1-2P42580 Sema4c-208ENSMUST00000195620 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nkx1-2P42580 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nkx1-2P42580 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nkx1-2P42580 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Nkx1-2P42580 Adamts13-201ENSMUST00000014996 3474 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nkx1-2P42580 Dglucy-202ENSMUST00000110069 3058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nkx1-2P42580 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nkx1-2P42580 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nkx1-2P42580 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nkx1-2P42580 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nkx1-2P42580 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Nkx1-2P42580 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Nkx1-2P42580 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nkx1-2P42580 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nkx1-2P42580 Steap3-201ENSMUST00000112639 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nkx1-2P42580 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nkx1-2P42580 Emilin1-201ENSMUST00000031055 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nkx1-2P42580 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nkx1-2P42580 Abcg4-201ENSMUST00000034648 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nkx1-2P42580 Gnb1l-204ENSMUST00000115601 3507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nkx1-2P42580 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nkx1-2P42580 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nkx1-2P42580 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nkx1-2P42580 Accs-202ENSMUST00000068513 1872 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nkx1-2P42580 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nkx1-2P42580 Bub3-203ENSMUST00000207442 3414 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nkx1-2P42580 Polm-201ENSMUST00000020767 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nkx1-2P42580 Cyb561d1-203ENSMUST00000106655 4275 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nkx1-2P42580 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nkx1-2P42580 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nkx1-2P42580 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nkx1-2P42580 Gm33677-201ENSMUST00000220074 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nkx1-2P42580 Gm26510-201ENSMUST00000180468 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nkx1-2P42580 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nkx1-2P42580 Gtf2ird1-203ENSMUST00000100650 3487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nkx1-2P42580 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nkx1-2P42580 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nkx1-2P42580 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nkx1-2P42580 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nkx1-2P42580 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nkx1-2P42580 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Nkx1-2P42580 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Nkx1-2P42580 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nkx1-2P42580 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nkx1-2P42580 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Nkx1-2P42580 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nkx1-2P42580 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Nkx1-2P42580 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Nkx1-2P42580 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nkx1-2P42580 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nkx1-2P42580 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms