Protein–RNA interactions for Protein: P23475

Xrcc6, X-ray repair cross-complementing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 608 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xrcc6P23475 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Xrcc6P23475 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Xrcc6P23475 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Xrcc6P23475 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Xrcc6P23475 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Xrcc6P23475 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Xrcc6P23475 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Xrcc6P23475 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Xrcc6P23475 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Xrcc6P23475 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Xrcc6P23475 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Xrcc6P23475 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Xrcc6P23475 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Xrcc6P23475 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Xrcc6P23475 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Xrcc6P23475 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Xrcc6P23475 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Xrcc6P23475 AC124171.1-201ENSMUST00000221151 567 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Xrcc6P23475 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Xrcc6P23475 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Xrcc6P23475 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Xrcc6P23475 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Xrcc6P23475 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Xrcc6P23475 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Xrcc6P23475 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Xrcc6P23475 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Xrcc6P23475 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Xrcc6P23475 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Xrcc6P23475 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Xrcc6P23475 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Xrcc6P23475 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Xrcc6P23475 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Xrcc6P23475 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Xrcc6P23475 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Xrcc6P23475 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Xrcc6P23475 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Xrcc6P23475 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Xrcc6P23475 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Xrcc6P23475 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Xrcc6P23475 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Xrcc6P23475 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Xrcc6P23475 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC13.58□□□□□ -0.23
Xrcc6P23475 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Xrcc6P23475 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Xrcc6P23475 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Xrcc6P23475 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Xrcc6P23475 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Xrcc6P23475 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Xrcc6P23475 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Xrcc6P23475 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Xrcc6P23475 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Xrcc6P23475 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Xrcc6P23475 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Xrcc6P23475 Mir3102-201ENSMUST00000175555 104 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Xrcc6P23475 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Xrcc6P23475 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Xrcc6P23475 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Xrcc6P23475 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Xrcc6P23475 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Xrcc6P23475 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Xrcc6P23475 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Xrcc6P23475 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Xrcc6P23475 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Xrcc6P23475 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Xrcc6P23475 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Xrcc6P23475 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Xrcc6P23475 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Xrcc6P23475 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Xrcc6P23475 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Xrcc6P23475 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Xrcc6P23475 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Xrcc6P23475 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Xrcc6P23475 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Xrcc6P23475 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Xrcc6P23475 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Xrcc6P23475 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Xrcc6P23475 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Xrcc6P23475 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Xrcc6P23475 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Xrcc6P23475 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Xrcc6P23475 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Xrcc6P23475 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Xrcc6P23475 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Xrcc6P23475 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Xrcc6P23475 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Xrcc6P23475 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Xrcc6P23475 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Xrcc6P23475 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Xrcc6P23475 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Xrcc6P23475 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Xrcc6P23475 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Xrcc6P23475 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Xrcc6P23475 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Xrcc6P23475 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Xrcc6P23475 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Xrcc6P23475 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Xrcc6P23475 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Xrcc6P23475 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Xrcc6P23475 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Xrcc6P23475 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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