Protein–RNA interactions for Protein: P19246

Nefh, Neurofilament heavy polypeptide, mousemouse

Predictions only

Length 1,090 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NefhP19246 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
NefhP19246 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NefhP19246 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NefhP19246 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
NefhP19246 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
NefhP19246 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NefhP19246 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NefhP19246 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NefhP19246 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NefhP19246 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NefhP19246 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NefhP19246 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NefhP19246 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
NefhP19246 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NefhP19246 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NefhP19246 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
NefhP19246 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NefhP19246 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
NefhP19246 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
NefhP19246 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NefhP19246 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NefhP19246 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
NefhP19246 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
NefhP19246 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
NefhP19246 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NefhP19246 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NefhP19246 Gm12266-201ENSMUST00000120311 962 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
NefhP19246 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
NefhP19246 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
NefhP19246 1110038B12Rik-203ENSMUST00000173070 434 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NefhP19246 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
NefhP19246 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
NefhP19246 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NefhP19246 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NefhP19246 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
NefhP19246 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NefhP19246 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NefhP19246 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
NefhP19246 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NefhP19246 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NefhP19246 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NefhP19246 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NefhP19246 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NefhP19246 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NefhP19246 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NefhP19246 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NefhP19246 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NefhP19246 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
NefhP19246 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NefhP19246 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
NefhP19246 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NefhP19246 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
NefhP19246 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NefhP19246 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NefhP19246 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NefhP19246 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NefhP19246 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NefhP19246 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
NefhP19246 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NefhP19246 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NefhP19246 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
NefhP19246 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
NefhP19246 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NefhP19246 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
NefhP19246 Zfp157-203ENSMUST00000110912 886 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
NefhP19246 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
NefhP19246 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NefhP19246 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
NefhP19246 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
NefhP19246 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
NefhP19246 Gm17040-202ENSMUST00000170597 889 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
NefhP19246 Apoe-208ENSMUST00000174191 472 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
NefhP19246 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
NefhP19246 Gm27552-201ENSMUST00000183351 62 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
NefhP19246 Gm27844-201ENSMUST00000183613 62 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
NefhP19246 Gm44136-201ENSMUST00000203819 1106 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
NefhP19246 Gm17812-201ENSMUST00000204935 318 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
NefhP19246 Cotl1-203ENSMUST00000211873 826 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
NefhP19246 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NefhP19246 Gm14267-206ENSMUST00000226870 1209 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
NefhP19246 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NefhP19246 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NefhP19246 Mill2-201ENSMUST00000072386 1121 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NefhP19246 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NefhP19246 Olfr605-201ENSMUST00000080660 1011 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
NefhP19246 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
NefhP19246 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NefhP19246 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NefhP19246 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
NefhP19246 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
NefhP19246 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NefhP19246 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NefhP19246 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NefhP19246 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NefhP19246 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
NefhP19246 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NefhP19246 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NefhP19246 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NefhP19246 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
NefhP19246 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms