Protein–RNA interactions for Protein: P11477

Defa1, Alpha-defensin 1, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa1P11477 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
Defa1P11477 Neurod6-201ENSMUST00000044767 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
Defa1P11477 3830432H09Rik-202ENSMUST00000188909 2414 ntTSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
Defa1P11477 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1
Defa1P11477 Tiam2-202ENSMUST00000169838 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1
Defa1P11477 Inf2-201ENSMUST00000101029 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1
Defa1P11477 Papln-201ENSMUST00000021646 4260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1
Defa1P11477 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1
Defa1P11477 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1
Defa1P11477 Ncdn-201ENSMUST00000030637 3681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1
Defa1P11477 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.77□□□□□ -1
Defa1P11477 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC8.77□□□□□ -1
Defa1P11477 Dpep1-201ENSMUST00000019422 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Defa1P11477 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.77□□□□□ -1.01
Defa1P11477 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Defa1P11477 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Defa1P11477 Ebf3-202ENSMUST00000106118 3736 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.77□□□□□ -1.01
Defa1P11477 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC8.77□□□□□ -1.01
Defa1P11477 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.77□□□□□ -1.01
Defa1P11477 Mfsd4b5-203ENSMUST00000164566 2372 ntTSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Defa1P11477 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC8.77□□□□□ -1.01
Defa1P11477 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Defa1P11477 Phip-201ENSMUST00000034787 10756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Defa1P11477 Cacna1c-224ENSMUST00000219018 7516 ntTSL 5 BASIC8.77□□□□□ -1.01
Defa1P11477 Sh2d5-201ENSMUST00000105823 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Defa1P11477 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Defa1P11477 Dcaf8-202ENSMUST00000191689 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Defa1P11477 Zfp941-201ENSMUST00000080651 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Defa1P11477 A130077B15Rik-201ENSMUST00000219429 2547 ntTSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Defa1P11477 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Defa1P11477 Gm43622-201ENSMUST00000200140 2019 ntBASIC8.77□□□□□ -1.01
Defa1P11477 Telo2-201ENSMUST00000024987 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Defa1P11477 Stard4-201ENSMUST00000025236 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Defa1P11477 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC8.77□□□□□ -1.01
Defa1P11477 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC8.77□□□□□ -1.01
Defa1P11477 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC8.77□□□□□ -1.01
Defa1P11477 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Defa1P11477 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Defa1P11477 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC8.77□□□□□ -1.01
Defa1P11477 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC8.77□□□□□ -1.01
Defa1P11477 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC8.77□□□□□ -1.01
Defa1P11477 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC8.77□□□□□ -1.01
Defa1P11477 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC8.77□□□□□ -1.01
Defa1P11477 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC8.77□□□□□ -1.01
Defa1P11477 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Defa1P11477 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Defa1P11477 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Defa1P11477 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC8.77□□□□□ -1.01
Defa1P11477 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Defa1P11477 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Defa1P11477 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Defa1P11477 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC8.77□□□□□ -1.01
Defa1P11477 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Defa1P11477 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC8.77□□□□□ -1.01
Defa1P11477 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.77□□□□□ -1.01
Defa1P11477 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Defa1P11477 Dlk1-201ENSMUST00000056110 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Defa1P11477 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Defa1P11477 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Defa1P11477 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Defa1P11477 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Defa1P11477 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Defa1P11477 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC8.77□□□□□ -1.01
Defa1P11477 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Defa1P11477 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Defa1P11477 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Defa1P11477 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Defa1P11477 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.77□□□□□ -1.01
Defa1P11477 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.77□□□□□ -1.01
Defa1P11477 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Defa1P11477 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Defa1P11477 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Defa1P11477 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.76□□□□□ -1.01
Defa1P11477 Uspl1-201ENSMUST00000050472 3757 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Defa1P11477 Ttc30b-201ENSMUST00000099996 2737 ntAPPRIS P1 BASIC8.76□□□□□ -1.01
Defa1P11477 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Defa1P11477 Fam26e-201ENSMUST00000069125 5323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Defa1P11477 Slc39a14-202ENSMUST00000068044 4926 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
Defa1P11477 Kif19a-201ENSMUST00000084368 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Defa1P11477 Rbl2-210ENSMUST00000211136 4504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Defa1P11477 Ror2-202ENSMUST00000130235 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Defa1P11477 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Defa1P11477 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Defa1P11477 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Defa1P11477 Gm14137-201ENSMUST00000069711 3067 ntAPPRIS P1 BASIC8.76□□□□□ -1.01
Defa1P11477 Caprin1-202ENSMUST00000111147 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Defa1P11477 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Defa1P11477 Zfp593-201ENSMUST00000030644 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Defa1P11477 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Defa1P11477 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Defa1P11477 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Defa1P11477 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC8.76□□□□□ -1.01
Defa1P11477 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Defa1P11477 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
Defa1P11477 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC8.76□□□□□ -1.01
Defa1P11477 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC8.76□□□□□ -1.01
Defa1P11477 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Defa1P11477 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
Defa1P11477 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Defa1P11477 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms