Protein–RNA interactions for Protein: O43679

LDB2, LIM domain-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LDB2O43679 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LDB2O43679 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LDB2O43679 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LDB2O43679 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LDB2O43679 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LDB2O43679 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LDB2O43679 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LDB2O43679 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LDB2O43679 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LDB2O43679 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LDB2O43679 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LDB2O43679 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LDB2O43679 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LDB2O43679 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LDB2O43679 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LDB2O43679 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LDB2O43679 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LDB2O43679 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LDB2O43679 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LDB2O43679 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LDB2O43679 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LDB2O43679 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LDB2O43679 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LDB2O43679 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LDB2O43679 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LDB2O43679 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LDB2O43679 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LDB2O43679 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LDB2O43679 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
LDB2O43679 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LDB2O43679 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LDB2O43679 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LDB2O43679 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LDB2O43679 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LDB2O43679 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LDB2O43679 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LDB2O43679 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LDB2O43679 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LDB2O43679 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LDB2O43679 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LDB2O43679 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LDB2O43679 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LDB2O43679 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LDB2O43679 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LDB2O43679 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LDB2O43679 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
LDB2O43679 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LDB2O43679 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LDB2O43679 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LDB2O43679 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LDB2O43679 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LDB2O43679 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
LDB2O43679 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LDB2O43679 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
LDB2O43679 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LDB2O43679 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LDB2O43679 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
LDB2O43679 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LDB2O43679 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LDB2O43679 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LDB2O43679 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LDB2O43679 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LDB2O43679 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LDB2O43679 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LDB2O43679 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LDB2O43679 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
LDB2O43679 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LDB2O43679 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LDB2O43679 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LDB2O43679 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LDB2O43679 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LDB2O43679 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LDB2O43679 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
LDB2O43679 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LDB2O43679 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LDB2O43679 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LDB2O43679 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LDB2O43679 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LDB2O43679 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LDB2O43679 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LDB2O43679 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
LDB2O43679 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
LDB2O43679 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LDB2O43679 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LDB2O43679 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LDB2O43679 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LDB2O43679 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LDB2O43679 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LDB2O43679 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
LDB2O43679 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
LDB2O43679 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
LDB2O43679 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LDB2O43679 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LDB2O43679 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LDB2O43679 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
LDB2O43679 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LDB2O43679 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
LDB2O43679 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LDB2O43679 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LDB2O43679 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 150.8 ms