Protein–RNA interactions for Protein: O35491

Clk2, Dual specificity protein kinase CLK2, mousemouse

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Length 499 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clk2O35491 Glmp-208ENSMUST00000176519 447 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Clk2O35491 Gm28287-201ENSMUST00000186612 546 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Clk2O35491 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Clk2O35491 Gm34728-201ENSMUST00000201510 414 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Clk2O35491 Gm7848-201ENSMUST00000210739 718 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Clk2O35491 Abhd14a-201ENSMUST00000048685 1256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Clk2O35491 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Clk2O35491 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Clk2O35491 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Clk2O35491 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Clk2O35491 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Clk2O35491 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Clk2O35491 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Clk2O35491 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Clk2O35491 Cyp4f16-208ENSMUST00000169591 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Clk2O35491 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Clk2O35491 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Clk2O35491 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Clk2O35491 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Clk2O35491 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Clk2O35491 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Clk2O35491 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Clk2O35491 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Clk2O35491 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Clk2O35491 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Clk2O35491 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Clk2O35491 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Clk2O35491 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Clk2O35491 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Clk2O35491 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Clk2O35491 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Clk2O35491 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Clk2O35491 Ucp3-202ENSMUST00000107059 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Clk2O35491 Gltp-202ENSMUST00000112212 799 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Clk2O35491 Mageb17-ps-201ENSMUST00000117902 919 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Clk2O35491 Eef1akmt2-202ENSMUST00000120425 573 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Clk2O35491 Gm14249-201ENSMUST00000156239 1017 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Clk2O35491 Gm38304-201ENSMUST00000161826 600 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Clk2O35491 Gm17334-201ENSMUST00000170390 907 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Clk2O35491 Lsm2-207ENSMUST00000173004 870 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Clk2O35491 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Clk2O35491 Ighv4-2-201ENSMUST00000192975 362 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Clk2O35491 Gm33222-201ENSMUST00000193725 654 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Clk2O35491 4930448A20Rik-201ENSMUST00000205988 1034 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Clk2O35491 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Clk2O35491 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Clk2O35491 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Clk2O35491 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Clk2O35491 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Clk2O35491 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Clk2O35491 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Clk2O35491 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Clk2O35491 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Clk2O35491 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Clk2O35491 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Clk2O35491 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Clk2O35491 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC13.33□□□□□ -0.27
Clk2O35491 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Clk2O35491 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Clk2O35491 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Clk2O35491 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Clk2O35491 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Clk2O35491 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Clk2O35491 Ighg2c-201ENSMUST00000103416 1214 ntAPPRIS P5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Clk2O35491 Gm21859-201ENSMUST00000178424 1045 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Clk2O35491 Hcfc1r1-203ENSMUST00000180140 693 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Clk2O35491 Lysmd4-208ENSMUST00000208698 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Clk2O35491 8030455M16Rik-201ENSMUST00000213014 902 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Clk2O35491 AC167229.2-201ENSMUST00000218902 675 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Clk2O35491 C1qb-201ENSMUST00000046384 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Clk2O35491 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Clk2O35491 Sftpd-201ENSMUST00000077136 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Clk2O35491 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Clk2O35491 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Clk2O35491 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Clk2O35491 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Clk2O35491 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Clk2O35491 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Clk2O35491 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Clk2O35491 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Clk2O35491 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Clk2O35491 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Clk2O35491 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Clk2O35491 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Clk2O35491 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Clk2O35491 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Clk2O35491 Acp5-203ENSMUST00000165735 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Clk2O35491 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Clk2O35491 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Clk2O35491 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Clk2O35491 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Clk2O35491 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Clk2O35491 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Clk2O35491 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Clk2O35491 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Clk2O35491 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Clk2O35491 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Clk2O35491 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Clk2O35491 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Clk2O35491 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
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