Protein–RNA interactions for Protein: J3QM43

Gm6594, Predicted pseudogene 6594, mousemouse

Predictions only

Length 95 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6594J3QM43 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm6594J3QM43 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm6594J3QM43 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm6594J3QM43 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm6594J3QM43 Adcy9-201ENSMUST00000005719 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm6594J3QM43 Dmbt1-206ENSMUST00000213064 5779 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm6594J3QM43 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm6594J3QM43 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm6594J3QM43 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm6594J3QM43 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm6594J3QM43 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm6594J3QM43 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm6594J3QM43 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm6594J3QM43 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm6594J3QM43 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm6594J3QM43 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm6594J3QM43 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm6594J3QM43 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm6594J3QM43 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm6594J3QM43 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm6594J3QM43 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm6594J3QM43 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm6594J3QM43 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm6594J3QM43 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm6594J3QM43 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm6594J3QM43 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm6594J3QM43 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm6594J3QM43 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm6594J3QM43 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm6594J3QM43 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm6594J3QM43 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm6594J3QM43 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm6594J3QM43 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm6594J3QM43 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm6594J3QM43 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm6594J3QM43 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm6594J3QM43 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm6594J3QM43 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm6594J3QM43 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm6594J3QM43 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm6594J3QM43 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm6594J3QM43 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm6594J3QM43 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm6594J3QM43 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm6594J3QM43 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm6594J3QM43 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm6594J3QM43 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm6594J3QM43 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm6594J3QM43 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm6594J3QM43 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm6594J3QM43 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm6594J3QM43 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm6594J3QM43 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm6594J3QM43 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm6594J3QM43 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm6594J3QM43 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm6594J3QM43 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm6594J3QM43 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm6594J3QM43 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm6594J3QM43 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm6594J3QM43 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm6594J3QM43 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm6594J3QM43 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm6594J3QM43 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm6594J3QM43 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm6594J3QM43 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm6594J3QM43 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm6594J3QM43 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm6594J3QM43 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm6594J3QM43 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm6594J3QM43 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm6594J3QM43 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm6594J3QM43 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm6594J3QM43 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm6594J3QM43 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm6594J3QM43 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm6594J3QM43 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm6594J3QM43 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm6594J3QM43 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm6594J3QM43 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm6594J3QM43 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm6594J3QM43 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm6594J3QM43 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm6594J3QM43 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm6594J3QM43 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm6594J3QM43 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm6594J3QM43 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm6594J3QM43 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm6594J3QM43 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm6594J3QM43 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm6594J3QM43 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm6594J3QM43 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm6594J3QM43 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm6594J3QM43 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm6594J3QM43 Cald1-205ENSMUST00000115027 4777 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm6594J3QM43 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm6594J3QM43 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm6594J3QM43 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm6594J3QM43 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm6594J3QM43 Stox2-209ENSMUST00000211882 9696 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.7 ms