Protein–RNA interactions for Protein: G5E8Z2

Taf4b, Transcription initiation factor TFIID subunit 4B, mousemouse

Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf4bG5E8Z2 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Taf4bG5E8Z2 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Taf4bG5E8Z2 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Taf4bG5E8Z2 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Taf4bG5E8Z2 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Taf4bG5E8Z2 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Taf4bG5E8Z2 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Taf4bG5E8Z2 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Taf4bG5E8Z2 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Taf4bG5E8Z2 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Taf4bG5E8Z2 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Taf4bG5E8Z2 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Taf4bG5E8Z2 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Taf4bG5E8Z2 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Taf4bG5E8Z2 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Taf4bG5E8Z2 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Taf4bG5E8Z2 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Taf4bG5E8Z2 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Taf4bG5E8Z2 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Taf4bG5E8Z2 Gm4755-201ENSMUST00000181803 2647 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Taf4bG5E8Z2 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Taf4bG5E8Z2 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Taf4bG5E8Z2 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Taf4bG5E8Z2 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Taf4bG5E8Z2 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Taf4bG5E8Z2 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Taf4bG5E8Z2 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Taf4bG5E8Z2 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Taf4bG5E8Z2 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Taf4bG5E8Z2 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Taf4bG5E8Z2 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Taf4bG5E8Z2 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Taf4bG5E8Z2 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Taf4bG5E8Z2 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Taf4bG5E8Z2 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Taf4bG5E8Z2 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Taf4bG5E8Z2 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Taf4bG5E8Z2 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Taf4bG5E8Z2 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Taf4bG5E8Z2 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Taf4bG5E8Z2 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Taf4bG5E8Z2 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Taf4bG5E8Z2 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Taf4bG5E8Z2 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Taf4bG5E8Z2 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Taf4bG5E8Z2 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Taf4bG5E8Z2 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Taf4bG5E8Z2 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Taf4bG5E8Z2 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Taf4bG5E8Z2 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Taf4bG5E8Z2 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Taf4bG5E8Z2 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Taf4bG5E8Z2 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Taf4bG5E8Z2 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Taf4bG5E8Z2 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Taf4bG5E8Z2 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Taf4bG5E8Z2 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Taf4bG5E8Z2 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Taf4bG5E8Z2 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Taf4bG5E8Z2 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Taf4bG5E8Z2 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Taf4bG5E8Z2 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Taf4bG5E8Z2 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Taf4bG5E8Z2 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Taf4bG5E8Z2 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Taf4bG5E8Z2 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Taf4bG5E8Z2 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Taf4bG5E8Z2 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Taf4bG5E8Z2 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Taf4bG5E8Z2 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Taf4bG5E8Z2 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Taf4bG5E8Z2 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Taf4bG5E8Z2 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Taf4bG5E8Z2 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Taf4bG5E8Z2 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Taf4bG5E8Z2 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Taf4bG5E8Z2 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Taf4bG5E8Z2 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Taf4bG5E8Z2 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Taf4bG5E8Z2 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Taf4bG5E8Z2 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Taf4bG5E8Z2 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Taf4bG5E8Z2 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Taf4bG5E8Z2 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Taf4bG5E8Z2 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Taf4bG5E8Z2 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Taf4bG5E8Z2 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Taf4bG5E8Z2 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Taf4bG5E8Z2 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Taf4bG5E8Z2 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Taf4bG5E8Z2 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Taf4bG5E8Z2 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Taf4bG5E8Z2 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Taf4bG5E8Z2 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Taf4bG5E8Z2 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Taf4bG5E8Z2 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Taf4bG5E8Z2 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Taf4bG5E8Z2 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
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