Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9N2

Cldn34b2, Claudin 34B2, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34b2Q9D9N2 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
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Cldn34b2Q9D9N2 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
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Cldn34b2Q9D9N2 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Cldn34b2Q9D9N2 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Cldn34b2Q9D9N2 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
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Cldn34b2Q9D9N2 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Cldn34b2Q9D9N2 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Cldn34b2Q9D9N2 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Cldn34b2Q9D9N2 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Cldn34b2Q9D9N2 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Cldn34b2Q9D9N2 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Cldn34b2Q9D9N2 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Cldn34b2Q9D9N2 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Cldn34b2Q9D9N2 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Cldn34b2Q9D9N2 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Cldn34b2Q9D9N2 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
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Cldn34b2Q9D9N2 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Cldn34b2Q9D9N2 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Cldn34b2Q9D9N2 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Cldn34b2Q9D9N2 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Cldn34b2Q9D9N2 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Cldn34b2Q9D9N2 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Cldn34b2Q9D9N2 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Cldn34b2Q9D9N2 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Cldn34b2Q9D9N2 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Cldn34b2Q9D9N2 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Cldn34b2Q9D9N2 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Cldn34b2Q9D9N2 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Cldn34b2Q9D9N2 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Cldn34b2Q9D9N2 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Cldn34b2Q9D9N2 Il15ra-204ENSMUST00000114832 468 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
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Cldn34b2Q9D9N2 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
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Cldn34b2Q9D9N2 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Cldn34b2Q9D9N2 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Cldn34b2Q9D9N2 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Cldn34b2Q9D9N2 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Cldn34b2Q9D9N2 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Cldn34b2Q9D9N2 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Cldn34b2Q9D9N2 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
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Cldn34b2Q9D9N2 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Cldn34b2Q9D9N2 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Cldn34b2Q9D9N2 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Cldn34b2Q9D9N2 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Cldn34b2Q9D9N2 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Cldn34b2Q9D9N2 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Cldn34b2Q9D9N2 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Cldn34b2Q9D9N2 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Cldn34b2Q9D9N2 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Cldn34b2Q9D9N2 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Cldn34b2Q9D9N2 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Cldn34b2Q9D9N2 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Cldn34b2Q9D9N2 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Cldn34b2Q9D9N2 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Cldn34b2Q9D9N2 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Cldn34b2Q9D9N2 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Cldn34b2Q9D9N2 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Cldn34b2Q9D9N2 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Cldn34b2Q9D9N2 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Cldn34b2Q9D9N2 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Cldn34b2Q9D9N2 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Cldn34b2Q9D9N2 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Cldn34b2Q9D9N2 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Cldn34b2Q9D9N2 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Cldn34b2Q9D9N2 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Cldn34b2Q9D9N2 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
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Cldn34b2Q9D9N2 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Cldn34b2Q9D9N2 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Cldn34b2Q9D9N2 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Cldn34b2Q9D9N2 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
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