Protein–RNA interactions for Protein: Q99KN2

Ciao1, Probable cytosolic iron-sulfur protein assembly protein CIAO1, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ciao1Q99KN2 Gm15515-201ENSMUST00000117827 822 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Ciao1Q99KN2 Gm12566-201ENSMUST00000121479 359 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Ciao1Q99KN2 Ankrd29-202ENSMUST00000122408 850 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ciao1Q99KN2 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ciao1Q99KN2 Gm26782-202ENSMUST00000181697 971 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ciao1Q99KN2 Gm42629-201ENSMUST00000199063 1102 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Ciao1Q99KN2 Abhd11os-203ENSMUST00000222613 363 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Ciao1Q99KN2 Tmem210-201ENSMUST00000028340 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ciao1Q99KN2 Abhd14a-201ENSMUST00000048685 1256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ciao1Q99KN2 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ciao1Q99KN2 Gm26448-201ENSMUST00000082446 203 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Ciao1Q99KN2 Tnni3-201ENSMUST00000098859 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ciao1Q99KN2 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ciao1Q99KN2 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ciao1Q99KN2 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ciao1Q99KN2 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ciao1Q99KN2 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ciao1Q99KN2 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ciao1Q99KN2 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ciao1Q99KN2 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ciao1Q99KN2 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ciao1Q99KN2 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ciao1Q99KN2 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ciao1Q99KN2 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ciao1Q99KN2 Gm43289-201ENSMUST00000200537 1475 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Ciao1Q99KN2 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ciao1Q99KN2 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Ciao1Q99KN2 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ciao1Q99KN2 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ciao1Q99KN2 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ciao1Q99KN2 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ciao1Q99KN2 B9d1os-201ENSMUST00000137010 674 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Ciao1Q99KN2 Gm35986-201ENSMUST00000197370 655 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ciao1Q99KN2 AC131330.1-201ENSMUST00000227814 1015 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Ciao1Q99KN2 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ciao1Q99KN2 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ciao1Q99KN2 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ciao1Q99KN2 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Ciao1Q99KN2 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ciao1Q99KN2 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ciao1Q99KN2 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ciao1Q99KN2 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ciao1Q99KN2 Cyp4f16-208ENSMUST00000169591 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ciao1Q99KN2 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ciao1Q99KN2 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ciao1Q99KN2 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ciao1Q99KN2 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ciao1Q99KN2 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ciao1Q99KN2 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ciao1Q99KN2 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ciao1Q99KN2 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ciao1Q99KN2 AC159308.2-201ENSMUST00000213592 2325 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Ciao1Q99KN2 Gm10152-201ENSMUST00000193475 1344 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Ciao1Q99KN2 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ciao1Q99KN2 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ciao1Q99KN2 Gm11450-201ENSMUST00000121144 333 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Ciao1Q99KN2 Cep97-206ENSMUST00000122280 1057 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ciao1Q99KN2 AA672651-201ENSMUST00000151550 489 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ciao1Q99KN2 Hcfc1r1-203ENSMUST00000180140 693 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ciao1Q99KN2 Gm28287-201ENSMUST00000186612 546 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ciao1Q99KN2 Gm3332-201ENSMUST00000189337 928 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Ciao1Q99KN2 Gm28778-201ENSMUST00000190734 785 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ciao1Q99KN2 Atraid-205ENSMUST00000201136 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ciao1Q99KN2 Gm5705-201ENSMUST00000066241 711 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Ciao1Q99KN2 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ciao1Q99KN2 AC126257.1-201ENSMUST00000213195 1536 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Ciao1Q99KN2 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ciao1Q99KN2 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ciao1Q99KN2 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ciao1Q99KN2 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ciao1Q99KN2 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Ciao1Q99KN2 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ciao1Q99KN2 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ciao1Q99KN2 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ciao1Q99KN2 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ciao1Q99KN2 Cyb5rl-202ENSMUST00000106756 1604 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ciao1Q99KN2 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ciao1Q99KN2 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ciao1Q99KN2 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ciao1Q99KN2 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ciao1Q99KN2 Gm9333-201ENSMUST00000205452 1323 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Ciao1Q99KN2 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ciao1Q99KN2 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ciao1Q99KN2 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ciao1Q99KN2 Timm10b-204ENSMUST00000106784 494 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ciao1Q99KN2 Gm15610-201ENSMUST00000120584 195 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Ciao1Q99KN2 Gm12196-201ENSMUST00000120954 262 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Ciao1Q99KN2 Platr29-201ENSMUST00000130022 830 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ciao1Q99KN2 Gm1667-201ENSMUST00000151651 558 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ciao1Q99KN2 Cd63-ps-202ENSMUST00000154992 717 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Ciao1Q99KN2 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ciao1Q99KN2 AC133602.1-201ENSMUST00000227510 509 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Ciao1Q99KN2 Krtap19-1-201ENSMUST00000081334 493 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ciao1Q99KN2 Gm9072-201ENSMUST00000218390 1514 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Ciao1Q99KN2 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ciao1Q99KN2 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ciao1Q99KN2 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ciao1Q99KN2 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ciao1Q99KN2 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ciao1Q99KN2 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms